@article{UBHD-68593496, author={Chua, Robert Lorenz and Lukassen, Soeren and Trump, Saskia and Hennig, Bianca P. and Wendisch, Daniel and Pott, Fabian and Debnath, Olivia and Th{\"u}rmann, Loreen and Kurth, Florian and V{\"o}lker, Maria Theresa and Kazmierski, Julia and Timmermann, Bernd and Twardziok, Sven and Schneider, Stefan and Machleidt, Felix and M{\"u}ller-Redetzky, Holger and Maier, Melanie and Krannich, Alexander and Schmidt, Sein and Balzer, Felix and Liebig, Johannes and Loske, Jennifer and Suttorp, Norbert and Eils, J{\"u}rgen and Ishaque, Naveed and Liebert, Uwe Gerd and Kalle, Christof von and Hocke, Andreas and Witzenrath, Martin and Goffinet, Christine and Drosten, Christian and Laudi, Sven and Lehmann, Irina and Conrad, Christian and Sander, Leif Erik and Eils, Roland}, title={COVID-19 severity correlates with airway epithelium-immune cell interactions identified by single-cell analysis}, year={2020}, pages={970-979}, language={eng}, issn={1546-1696}, volume={38}, number={8}, note={Das PDF enth{\"a}lt zus{\"a}tzlich einen Anhang von 15 Seiten ; Gesehen am 29.06.2020}, journal={Nature biotechnology}, doi={10.1038/s41587-020-0602-4}, } @article{UBHD-68384336, author={Glont, Mihai and Eils, J{\"u}rgen and Eils, Roland}, title={BioModels}, subtitle={expanding horizons to include more modelling approaches and formats}, year={2018}, pages={D1248-D1253}, language={eng}, issn={1362-4962}, volume={46}, number={D1}, note={ Published: 02 November 2017 ; Gesehen am 03.05.2019}, journal={Nucleic acids research}, doi={10.1093/nar/gkx1023}, } @article{UBHD-68570567, author={Gr{\"o}bner, Susanne and Jones, Barbara Christine and Buchhalter, Ivo and Johann, Pascal-David and Balasubramanian, Gnana Prakash and Bender, Sebastian and Hutter, Barbara and Sturm, Dominik and Pfaff, Elke and H{\"u}bschmann, Daniel and Heinold, Michael and Eils, J{\"u}rgen and Kulozik, Andreas and Witt, Hendrik and Witt, Olaf and Tilburg, Cornelis M. van and Klingebiel, Thomas and Brors, Benedikt and Pajtler, Kristian Wilfried and Kool, Marcel and Korbel, Jan Oliver and Schlesner, Matthias and Eils, Roland and Jones, David T. W. and Lichter, Peter and Zapatka, Marc and Pfister, Stefan}, title={Author correction: The landscape of genomic alterations across childhood cancers}, year={2018}, pages={E10-E10}, language={eng}, issn={1476-4687}, volume={559}, number={7714}, note={Gesehen am 27.04.2020}, journal={Nature}, doi={10.1038/s41586-018-0167-2}, } @article{UBHD-68227032, author={Gr{\"o}bner, Susanne and Jones, Barbara Christine and Buchhalter, Ivo and Johann, Pascal-David and Balasubramanian, Gnana Prakash and Bender, Sebastian and Sturm, Dominik and Pfaff, Elke and H{\"u}bschmann, Daniel and Heinold, Michael and Eils, J{\"u}rgen and Kulozik, Andreas and Witt, Hendrik and Tilburg, Cornelis M. van and Pajtler, Kristian Wilfried and Kool, Marcel and Eils, Roland and Jones, David T. W. and Lichter, Peter and Zapatka, Marc and Korshunov, Andrey and Witt, Olaf and Pfister, Stefan}, title={The landscape of genomic alterations across childhood cancers}, year={2018}, pages={321-327}, language={eng}, issn={1476-4687}, volume={555}, note={Author correction: Susanne N. Gr{\"o}bner, Barbara C. Worst, Joachim Weischenfeldt, Ivo Buchhalter, Kortine Kleinheinz, Vasilisa A. Rudneva, Pascal D. Johann, Gnana Prakash Balasubramanian, Maia Segura-Wang, Sebastian Brabetz, Sebastian Bender, Barbara Hutter, Dominik Sturm, Elke Pfaff, Daniel H{\"u}bschmann, Gideon Zipprich, Michael Heinold, J{\"u}rgen Eils, Christian Lawerenz, Serap Erkek, Sander Lambo, Sebastian Waszak, Claudia Blattmann, Arndt Borkhardt, Michaela Kuhlen, Angelika Eggert, Simone Fulda, Manfred Gessler, Jenny Wegert, Roland Kappler, Daniel Baumhoer, Stefan Burdach, Renate Kirschner-Schwabe, Udo Kontny, Andreas E. Kulozik, Dietmar Lohmann, Simone Hettmer, Cornelia Eckert, Stefan Bielack, Michaela Nathrath, Charlotte Niemeyer, G{\"u}nther H. Richter, Johannes Schulte, Reiner Siebert, Frank Westermann, Jan J. Molenaar, Gilles Vassal, Hendrik Witt, ICGC PedBrain-Seq Project, ICGC MMML-Seq Project, Birgit Burkhardt, Christian P. Kratz, Olaf Witt, Cornelis M. van Tilburg, Christof M. Kramm, Gudrun Fleischhack, Uta Dirksen, Stefan Rutkowski, Michael Fr{\"u}hwald, Katja von Hoff, Stephan Wolf, Thomas Klingebiel, Ewa Koscielniak, Pablo Landgraf, Jan Koster, Adam C. Resnick, Jinghui Zhang, Yanling Liu, Xin Zhou, Angela J. Waanders, Danny A. Zwijnenburg, Pichai Raman, Benedikt Brors, Ursula D. Weber, Paul A. Northcott, Kristian W. Pajtler, Marcel Kool, Rosario M. Piro, Jan O. Korbel, Matthias Schlesner, Roland Eils, David T.W. Jones, Peter Lichter, Lukas Chavez, Marc Zapatka & Stefan M. Pfister ; Gesehen am 06.03.2018}, journal={Nature}, doi={10.1038/nature25480}, } @book{UBHD-68422960, author={H{\"o}fer, Thomas and Westermann, Frank and Eils, J{\"u}rgen and Brors, Benedikt and Korf, Ulrike}, organization={Deutsches Krebsforschungszentrum / Modellierung Biologischer Systeme}, title={Schlussbericht zum CancerSys-Verbundprojekt "MYC-NET - Aufkl{\"a}rung der Mechanismen MYC-getriebener Therapieresistenz neuroectodermaler Tumore", Teilprojekt Systembiologische Analyse}, subtitle={Systembiologie in der Krebsforschung - CancerSys : Laufzeit des Vorhabens: 01.03.2012-28.02.2015, zuwendungsneutrale Verl{\"a}ngerung: 01.03.2015-30.09.2015}, publisher={DKFZ}, address={Heidelberg}, year={2016}, pages={33 Seiten}, language={ger}, note={F{\"o}rderkennzeichen BMBF 0316076A. - Verbund-Nummer 01109385 ; Der Bericht umfasst die Arbeiten aus den Teilprojekten 2, 3 und 6 des MYC-NET Verbundprojekts ; Unterschiede zwischen dem gedruckten Dokument und der elektronischen Ressource k{\"o}nnen nicht ausgeschlossen werden}, keywords={Neuroblastom / Systembiologie / Genregulation / Myc}, } @book{UBHD-68422962, author={H{\"o}fer, Thomas and Westermann, Frank and Eils, J{\"u}rgen and Brors, Benedikt and Korf, Ulrike}, organization={Deutsches Krebsforschungszentrum / Modellierung Biologischer Systeme}, title={Schlussbericht zum CancerSys-Verbundprojekt "MYC-NET - Aufkl{\"a}rung der Mechanismen MYC-getriebener Therapieresistenz neuroectodermaler Tumore", Teilprojekt Systembiologische Analyse}, subtitle={Systembiologie in der Krebsforschung - CancerSys : Laufzeit des Vorhabens: 01.03.2012-28.02.2015, zuwendungsneutrale Verl{\"a}ngerung: 01.03.2015-30.09.2015}, publisher={DKFZ}, address={Heidelberg}, year={2016}, pages={1 Online-Ressource (33 Seiten, 639,98 KB)}, language={ger}, note={F{\"o}rderkennzeichen BMBF 0316076A. - Verbund-Nummer 01109385 ; Der Bericht umfasst die Arbeiten aus den Teilprojekten 2, 3 und 6 des MYC-NET Verbundprojekts ; Unterschiede zwischen dem gedruckten Dokument und der elektronischen Ressource k{\"o}nnen nicht ausgeschlossen werden}, doi={10.2314/GBV:883839237}, keywords={Neuroblastom / Systembiologie / Genregulation / Myc}, } @article{UBHD-67970363, author={Hovestadt, Volker and Jones, David T. W. and Kool, Marcel and Bartholom{\"a}, Cynthia C. and Kalle, Christof von and Eils, J{\"u}rgen and Milde, Till and Witt, Olaf and Scheurlen, Wolfram and Brors, Benedikt and Eils, Roland and Korshunov, Andrey and Zapatka, Marc and Pfister, Stefan and Lichter, Peter}, title={Decoding the regulatory landscape of medulloblastoma using DNA methylation sequencing}, year={2014}, pages={537-541}, language={eng}, issn={1476-4687}, volume={510}, number={7506}, note={Gesehen am 21.04.2016}, journal={Nature}, doi={10.1038/nature13268}, } @article{UBHD-68491160, author={Ishaque, Naveed and Abba, Mohammed L. and Patil, Nitin and Paramasivam, Nagarajan and H{\"u}bschmann, Daniel and Leupold, J{\"o}rg and Balasubramanian, Gnana Prakash and Kleinheinz, Kortine and Toprak, Umut and Hutter, Barbara and Benner, Axel and Kerssemakers, Jules and Marx, Alexander and Eils, J{\"u}rgen and Schlesner, Matthias and Eils, Roland and Brors, Benedikt and Allgayer, Heike}, title={Whole genome sequencing puts forward hypotheses on metastasis evolution and therapy in colorectal cancer}, year={2018}, pages={14 S.}, language={eng}, issn={2041-1723}, volume={9(2018) Artikel-Nummer 4782}, number={14 Seiten}, note={Gesehen am 19.02.2020}, journal={Nature Communications}, doi={10.1038/s41467-018-07041-z}, } @book{UBHD-68423027, author={Schlesner, Matthias and Eils, J{\"u}rgen}, organization={Universit{\"a}tsbibliothek Heidelberg}, title={Projekttitel: Charakterisierung des nicht-Protein-kodierenden Subgenoms in Tumorzellen durch Mining genomweiter Omics-Datens{\"a}tze aus den deutschen ICGC Projekten}, subtitle={Schlussbericht : Teilprojekt 1: Arbeitspakete 4, 7 : Teilprojekt 2: Arbeitspaket 6 : Teilprojekt 3: Arbeitspakete 6, 7 =}, publisher={Universit{\"a}t Heidelberg}, address={[Heidelberg]}, year={2018}, pages={6 ungez{\"a}hlte Bl{\"a}tter}, language={ger}, note={F{\"o}rderkennzeichen BMBF 01KU1505E. - Verbund-Nummer 01166347. ; Autoren dem Berichtsblatt entnommen. - Paralleltitel dem englischen Berichtsblatt entnommen. ; Unterschiede zwischen dem gedruckten Dokument und der elektronischen Ressource k{\"o}nnen nicht ausgeschlossen werden.}, keywords={Sequenzdaten / Lymphom / B-Zell-Lymphom / Burkitt-Lymphom / Genom / Transkriptom / Molekulare Medizin}, } @book{UBHD-68423029, author={Schlesner, Matthias and Eils, J{\"u}rgen}, organization={Universit{\"a}tsbibliothek Heidelberg}, title={Projekttitel: Charakterisierung des nicht-Protein-kodierenden Subgenoms in Tumorzellen durch Mining genomweiter Omics-Datens{\"a}tze aus den deutschen ICGC Projekten}, subtitle={Schlussbericht : Teilprojekt 1: Arbeitspakete 4, 7 : Teilprojekt 2: Arbeitspaket 6 : Teilprojekt 3: Arbeitspakete 6, 7}, publisher={Universit{\"a}t Heidelberg}, address={[Heidelberg]}, year={2018}, pages={1 Online-Ressource (6 Seiten, 99,55 KB)}, language={ger}, note={F{\"o}rderkennzeichen BMBF 01KU1505E. - Verbund-Nummer 01166347 ; Autoren dem Berichtsblatt entnommen. - Paralleltitel dem englischen Berichtsblatt entnommen ; Unterschiede zwischen dem gedruckten Dokument und der elektronischen Ressource k{\"o}nnen nicht ausgeschlossen werden}, doi={10.2314/GBV:1662942257}, keywords={Sequenzdaten / Lymphom / B-Zell-Lymphom / Burkitt-Lymphom / Genom / Transkriptom / Molekulare Medizin}, } @article{UBHD-68945269, author={Sommer, Kim K. and Amr, Ali and Bavendiek, Udo and Beierle, Felix and Brunecker, Peter and Dathe, Henning and Eils, J{\"u}rgen and Ertl, Maximilian and Fette, Georg and Gietzelt, Matthias and Heidecker, Bettina and Hellenkamp, Kristian and Heuschmann, Peter and Hoos, Jennifer D. E. and Keszty{\"u}s, Tibor and Kerwagen, Fabian and Kindermann, Aljoscha and Krefting, Dagmar and Landmesser, Ulf and Marschollek, Michael and Meder, Benjamin and Merzweiler, Angela and Prasser, Fabian and Pryss, R{\"u}diger and Richter, Jendrik and Schneider, Philipp and St{\"o}rk, Stefan and Dieterich, Christoph}, title={Structured, harmonized, and interoperable integration of clinical routine data to compute heart failure risk scores}, year={2022}, pages={1-18}, language={eng}, issn={2075-1729}, volume={12}, note={Gesehen am 21.07.2022 ; This article belongs to the special issue "Computational analysis of biomedical data"}, journal={Life}, doi={10.3390/life12050749}, } @article{UBHD-68794519, author={Weischenfeldt, Joachim and Simon, Ronald and Feuerbach, Lars and Schlangen, Karin and Weichenhan, Dieter and Minner, Sarah and Wuttig, Daniela and Warnatz, Hans-J{\"o}rg and Stehr, Henning and Rausch, Tobias and J{\"a}ger, Natalie and Gu, Lei and Bogatyrëva, Olga and St{\"u}tz, Adrian M. and Claus, Rainer and Eils, J{\"u}rgen and Eils, Roland and Gerh{\"a}user, Clarissa and Huang, Po-Hsien and Hutter, Barbara and Kabbe, Rolf and Lawerenz, Christian and Radomski, Sylwester and Bartholomae, Cynthia C. and F{\"a}lth Savitski, Maria and Gade, Stephan and Schmidt, Manfred and Amschler, Nina and Haß, Thomas and Galal, Rami and Gjoni, Jovisa and Kuner, Ruprecht and Baer, Constance and Masser, Sawinee and Kalle, Christof von and Zichner, Thomas and Benes, Vladimir and Raeder, Benjamin and Mader, Malte and Amstislavskiy, Vyacheslav and Avci, Meryem and Lehrach, Hans and Parkhomchuk, Dmitri and Sultan, Marc and Burkhardt, Lia and Graefen, Markus and Huland, Hartwig and Kluth, Martina and Krohn, Antje and Sirma, H{\"u}seyin and Stumm, Laura and Steurer, Stefan and Grupp, Katharina and S{\"u}ltmann, Holger and Sauter, Guido and Plass, Christoph and Brors, Benedikt and Yaspo, Marie-Laure and Korbel, Jan Oliver and Schlomm, Thorsten}, title={Integrative genomic analyses reveal an androgen-driven somatic alteration landscape in early-onset prostate cancer}, year={2013}, pages={159-170}, language={eng}, issn={1878-3686}, volume={23}, number={2}, note={Gesehen am 28.10.2021}, journal={Cancer cell}, doi={10.1016/j.ccr.2013.01.002}, } @book{UBHD-68422961, author={Wiemann, Stefan and Brors, Benedikt and Herzig, Stephan and Eils, J{\"u}rgen}, organization={Deutsches Krebsforschungszentrum}, title={Schlussbericht zu dem im Rahmen des e:Bio - Innovationswettbewerbs Systembiologie Projektes Systembiologie der metabolischen Transformation in Brustkrebs (SYSMET-BC, Systems biology of metabolic transformation in breast cancer)}, subtitle={Laufzeit des Vorhabens: 01.01.2013-30.4.2016}, publisher={Deutsches Krebsforschungszentrum}, address={Heidelberg}, year={2016}, pages={11 Bl{\"a}tter, 2 ungez{\"a}hlte Bl{\"a}tter}, language={ger}, note={F{\"o}rderkennzeichen BMBF 0316168C. - Verbund-Nummer 01125266 ; Autoren dem Berichtsblatt entnommen ; Unterschiede zwischen dem gedruckten Dokument und der elektronischen Ressource k{\"o}nnen nicht ausgeschlossen werden}, } @book{UBHD-68422964, author={Wiemann, Stefan and Brors, Benedikt and Herzig, Stephan and Eils, J{\"u}rgen}, organization={Deutsches Krebsforschungszentrum}, title={Schlussbericht zu dem im Rahmen des e:Bio - Innovationswettbewerbs Systembiologie Projektes Systembiologie der metabolischen Transformation in Brustkrebs (SYSMET-BC, Systems biology of metabolic transformation in breast cancer)}, subtitle={Laufzeit des Vorhabens: 01.01.2013-30.4.2016}, publisher={Deutsches Krebsforschungszentrum}, address={Heidelberg}, year={2016}, pages={1 Online-Ressource (13 Seiten, 497,32 KB)}, language={ger}, note={F{\"o}rderkennzeichen BMBF 0316168C. - Verbund-Nummer 01125266 ; Autoren dem Berichtsblatt entnommen ; Unterschiede zwischen dem gedruckten Dokument und der elektronischen Ressource k{\"o}nnen nicht ausgeschlossen werden}, doi={10.2314/GBV:885662806}, }