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Universitätsbibliothek Heidelberg
Status: Bibliographieeintrag

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 Online-Ressource
Verfasst von:Schwarz, Eva C. [VerfasserIn]   i
 Haas, Jan [VerfasserIn]   i
 Meder, Benjamin [VerfasserIn]   i
Titel:Deep characterization of blood cell miRNomes by NGS
Verf.angabe:Eva C. Schwarz, Christina Backes, Arne Knörck, Nicole Ludwig, Petra Leidinger, Cora Hoxha, Gertrud Schwär, Thomas Grossmann, Sabine C. Müller, Martin Hart, Jan Haas, Valentina Galata, Isabelle Müller, Tobias Fehlmann, Hermann Eichler, Andre Franke, Benjamin Meder, Eckart Meese, Markus Hoth, Andreas Keller
E-Jahr:2016
Jahr:August 2016
Umfang:13 S.
Fussnoten:Gesehen am 29.11.2018
Titel Quelle:Enthalten in: Cellular and molecular life sciences
Ort Quelle:Cham (ZG) : Springer International Publishing AG, 1997
Jahr Quelle:2016
Band/Heft Quelle:73(2016), 16, Seite 3169-3181
ISSN Quelle:1420-9071
Abstract:A systematic understanding of different factors influencing cell type specific microRNA profiles is essential for state-of-the art biomarker research. We carried out a comprehensive analysis of the biological variability and changes in cell type pattern over time for different cell types and different isolation approaches in technical replicates. All combinations of the parameters mentioned above have been measured, resulting in 108 miRNA profiles that were evaluated by next-generation-sequencing. The largest miRNA variability was due to inter-individual differences (34 %), followed by the cell types (23.4 %) and the isolation technique (17.2 %). The change over time in cell miRNA composition was moderate (<3 %) being close to the technical variations (<1 %). Largest variability (including technical and biological variance) was observed for CD8 cells while CD3 and CD4 cells showed significantly lower variations. ANOVA highlighted that 51.5 % of all miRNAs were significantly influenced by the purification technique. While CD4 cells were least affected, especially miRNA profiles of CD8 cells were fluctuating depending on the cell purification approach. To provide researchers access to the profiles and to allow further analyses of the tested conditions we implemented a dynamic web resource.
DOI:doi:10.1007/s00018-016-2154-9
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Volltext: http://dx.doi.org/10.1007/s00018-016-2154-9
 Volltext: https://doi.org/10.1007/s00018-016-2154-9
 DOI: https://doi.org/10.1007/s00018-016-2154-9
Datenträger:Online-Ressource
Sprache:eng
Sach-SW:Blood cells
 FACS
 microRNA
 Next-generation sequencing
K10plus-PPN:1584620382
Verknüpfungen:→ Zeitschrift

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