| |  Online-Ressource |
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| Verfasst von: | Buchmuller, Benjamin [VerfasserIn]  |
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| | Herbst, Konrad [VerfasserIn] |
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| | Meurer, Matthias [VerfasserIn] |
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| | Kirrmaier, Daniel [VerfasserIn] |
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| | Sass, Ehud [VerfasserIn] |
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| | Levy, Emmanuel D. [VerfasserIn] |
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| | Knop, Michael [VerfasserIn] |
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| Titel: | Pooled clone collections by multiplexed CRISPR/Cas12a-assisted gene tagging in yeast |
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| Verf.angabe: | Benjamin C. Buchmuller, Konrad Herbst, Matthias Meurer, Daniel Kirrmaier, Ehud Sass, Emmanuel D. Levy, Michael Knop |
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| E-Jahr: | 2018 |
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| Jahr: | November 22, 2018 |
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| Umfang: | 57 S. |
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| Fussnoten: | Gesehen am 16.05.2019 |
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| Titel Quelle: | Enthalten in: bioRxiv beta |
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| Ort Quelle: | Cold Spring Harbor : Cold Spring Harbor Laboratory, NY, 2013 |
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| Jahr Quelle: | 2018 |
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| Band/Heft Quelle: | (2018) Artikel-Nummer 476804, 57 Seiten |
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| Abstract: | Clone collections of modified strains (‘libraries’) are a major resource for systematic studies with the yeast <i>Saccharomyces cerevisiae</i>. Construction of such libraries is time-consuming, costly and confined to the genetic background of a specific yeast strain. To overcome these limitations, we developed CRISPR/Cas12a (Cpf1)-assisted tag library engineering (CASTLING) for multiplexed strain construction. CASTLING uses microarray-synthesized oligonucleotide pools and <i>in vitro</i> recombineering to program the genomic insertion of long DNA constructs via homologous recombination. One simple transformation yields pooled libraries with >90% of correctly tagged clones. Up to several hundred genes can be tagged in a single step and, on a genomic scale, approximately half of all genes are tagged with only ~10-fold oversampling. We report several parameters that affect tagging success and provide a quantitative targeted next-generation sequencing method to analyze such pooled collections. Thus, CASTLING unlocks new avenues for increased throughput in functional genomics and cell biology research. (max 150 words)</p> |
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| DOI: | doi:10.1101/476804 |
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| URL: | Bitte beachten Sie: Dies ist ein Bibliographieeintrag. Ein Volltextzugriff für Mitglieder der Universität besteht hier nur, falls für die entsprechende Zeitschrift/den entsprechenden Sammelband ein Abonnement besteht oder es sich um einen OpenAccess-Titel handelt.
Volltext ; Verlag: https://doi.org/10.1101/476804 |
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| | Volltext: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/476804v1 |
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| | DOI: https://doi.org/10.1101/476804 |
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| Datenträger: | Online-Ressource |
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| Sprache: | eng |
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| Bibliogr. Hinweis: | Forschungsdaten: Buchmuller, Benjamin, 1991 - : Pooled clone collections by multiplexed CRISPR-Cas12a-assisted gene tagging in yeast [dataset] |
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| K10plus-PPN: | 1665791055 |
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| Verknüpfungen: | → Sammelwerk |
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Pooled clone collections by multiplexed CRISPR/Cas12a-assisted gene tagging in yeast / Buchmuller, Benjamin [VerfasserIn]; November 22, 2018 (Online-Ressource)
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