| Online-Ressource |
Verfasst von: | Frindert, Jens [VerfasserIn]  |
| Zhang, Yaqing [VerfasserIn]  |
| Nübel, Gabriele [VerfasserIn]  |
| Hotz-Wagenblatt, Agnes [VerfasserIn]  |
| Burhenne, Jürgen [VerfasserIn]  |
| Haefeli, Walter E. [VerfasserIn]  |
| Jäschke, Andres [VerfasserIn]  |
Titel: | Identification, biosynthesis, and decapping of NAD-capped RNAs in B. subtilis |
Verf.angabe: | Jens Frindert, Yaqing Zhang, Gabriele Nübel, Masroor Kahloon, Leonie Kolmar, Agnes Hotz-Wagenblatt, Jürgen Burhenne, Walter E. Haefeli, Andres Jäschke |
E-Jahr: | 2018 |
Jahr: | August 14, 2018 |
Umfang: | 20 S. |
Fussnoten: | Gesehen am 07.08.2019 |
Titel Quelle: | Enthalten in: Cell reports |
Ort Quelle: | Maryland Heights, MO : Cell Press, 2012 |
Jahr Quelle: | 2018 |
Band/Heft Quelle: | 24(2018), 7, Seite 1890-1901,e1-e8 |
ISSN Quelle: | 2211-1247 |
Abstract: | Summary - The ubiquitous coenzyme nicotinamide adenine dinucleotide (NAD) decorates various RNAs in different organisms. In the proteobacterium Escherichia coli, the NAD-cap confers stability against RNA degradation. To date, NAD-RNAs have not been identified in any other bacterial microorganism. Here, we report the identification of NAD-RNA in the firmicute Bacillus subtilis. In the late exponential growth phase, predominantly mRNAs are NAD modified. NAD is incorporated de novo into RNA by the cellular RNA polymerase using non-canonical transcription initiation. The incorporation efficiency depends on the −1 position of the promoter but is independent of sigma factors or mutations in the rifampicin binding pocket. RNA pyrophosphohydrolase BsRppH is found to decap NAD-RNA. In vitro, the decapping activity is facilitated by manganese ions and single-stranded RNA 5′ ends. Depletion of BsRppH influences the gene expression of ∼13% of transcripts in B. subtilis. The NAD-cap stabilizes RNA against 5′-to-3′-exonucleolytic decay by RNase J1. |
DOI: | doi:10.1016/j.celrep.2018.07.047 |
URL: | Bitte beachten Sie: Dies ist ein Bibliographieeintrag. Ein Volltextzugriff für Mitglieder der Universität besteht hier nur, falls für die entsprechende Zeitschrift/den entsprechenden Sammelband ein Abonnement besteht oder es sich um einen OpenAccess-Titel handelt.
Volltext: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2018.07.047 |
| Volltext: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211124718311501 |
| DOI: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2018.07.047 |
Datenträger: | Online-Ressource |
Sprache: | eng |
Sach-SW: | Nudix hydrolases |
| RNA capping |
| RNA decapping |
| RNA decay |
| RNA modifications |
| RppH |
| transcription initiation |
K10plus-PPN: | 1670719456 |
Verknüpfungen: | → Zeitschrift |
Identification, biosynthesis, and decapping of NAD-capped RNAs in B. subtilis / Frindert, Jens [VerfasserIn]; August 14, 2018 (Online-Ressource)