| |  Online-Ressource |
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| Verfasst von: | Winter, Jan [VerfasserIn]  |
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| | Breinig, Marco [VerfasserIn] |
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| | Heigwer, Florian [VerfasserIn] |
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| | Brügemann, Dirk [VerfasserIn] |
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| | Leible, Svenja [VerfasserIn] |
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| | Zhan, Tianzuo [VerfasserIn] |
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| | Boutros, Michael [VerfasserIn] |
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| Titel: | CaRpools |
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| Titelzusatz: | an R package for exploratory data analysis and documentation of pooled CRISPR/Cas9 screens |
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| Verf.angabe: | Jan Winter, Marco Breinig, Florian Heigwer, Dirk Brügemann, Svenja Leible, Oliver Pelz, Tianzuo Zhan and Michael Boutros |
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| Jahr: | 2016 |
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| Umfang: | 3 S. |
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| Fussnoten: | Gesehen am 19.08.2019 ; Advance Access Publication Date: 27 October 2015 |
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| Titel Quelle: | Enthalten in: Bioinformatics |
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| Ort Quelle: | Oxford : Oxford Univ. Press, 1998 |
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| Jahr Quelle: | 2016 |
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| Band/Heft Quelle: | 32(2016), 4, Seite 632-634 |
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| ISSN Quelle: | 1367-4811 |
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| Abstract: | Motivation: Genetic screens by CRISPR/Cas9-mediated genome engineering have become a powerful tool for functional genomics. However, there is currently a lack of end-to-end software pipelines to analyze CRISPR/Cas9 screens based on next generation sequencing. Results: The CRISPR-AnalyzeR for pooled screens (caRpools) is an R package for exploratory data analysis that provides a complete workflow to analyze CRISPR/Cas9 screens. To further support the analysis of large-scale screens, caRpools integrates screening documentation and generation of standardized analysis reports. Availability and implementation: caRpools, manuals and an open virtual appliance are available at http://github.com/boutroslab/caRpools . |
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| DOI: | doi:10.1093/bioinformatics/btv617 |
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| URL: | Bitte beachten Sie: Dies ist ein Bibliographieeintrag. Ein Volltextzugriff für Mitglieder der Universität besteht hier nur, falls für die entsprechende Zeitschrift/den entsprechenden Sammelband ein Abonnement besteht oder es sich um einen OpenAccess-Titel handelt.
Volltext: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv617 |
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| | Volltext: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/32/4/632/1744042 |
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| | DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv617 |
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| Datenträger: | Online-Ressource |
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| Sprache: | eng |
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| K10plus-PPN: | 1671610520 |
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| Verknüpfungen: | → Zeitschrift |
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