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Universitätsbibliothek Heidelberg
Status: Bibliographieeintrag

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 Online-Ressource
Verfasst von:Bageritz, Josephine [VerfasserIn]   i
 Willnow, Philipp [VerfasserIn]   i
 Valentini, Erica [VerfasserIn]   i
 Leible, Svenja [VerfasserIn]   i
 Boutros, Michael [VerfasserIn]   i
 Teleman, Aurelio A. [VerfasserIn]   i
Titel:Gene expression atlas of a developing tissue by single cell expression correlation analysis
Verf.angabe:Josephine Bageritz, Philipp Willnow, Erica Valentini, Svenja Leible, Michael Boutros and Aurelio A. Teleman
E-Jahr:2019
Jahr:29 July 2019
Umfang:7 S.
Fussnoten:Gesehen am 12.09.2019
Titel Quelle:Enthalten in: Nature methods
Ort Quelle:London [u.a.] : Nature Publishing Group, 2004
Jahr Quelle:2019
Band/Heft Quelle:16(2019), 8, Seite 750-756
ISSN Quelle:1548-7105
Abstract:The Drosophila wing disc has been a fundamental model system for the discovery of key signaling pathways and for our understanding of developmental processes. However, a complete map of gene expression in this tissue is lacking. To obtain a gene expression atlas in the wing disc, we employed single cell RNA sequencing (scRNA-seq) and developed a method for analyzing scRNA-seq data based on gene expression correlations rather than cell mapping. This enables us to compute expression maps for all detected genes in the wing disc and to discover 824 genes with spatially restricted expression patterns. This approach identifies clusters of genes with similar expression patterns and functional relevance. As proof of concept, we characterize the previously unstudied gene CG5151 and show that it regulates Wnt signaling. Our method will enable the leveraging of scRNA-seq data for generating expression atlases of undifferentiated tissues during development.
DOI:doi:10.1038/s41592-019-0492-x
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Volltext: https://doi.org/10.1038/s41592-019-0492-x
 Volltext: https://www.nature.com/articles/s41592-019-0492-x
 DOI: https://doi.org/10.1038/s41592-019-0492-x
Datenträger:Online-Ressource
Sprache:eng
K10plus-PPN:1676790527
Verknüpfungen:→ Zeitschrift

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