| |  Online-Ressource |
|---|
| Verfasst von: | Holland, Christian H. [VerfasserIn]  |
|---|
| | Tanevski, Jovan [VerfasserIn] |
|---|
| | Perales-Patón, Javier [VerfasserIn] |
|---|
| | Gleixner, Jan [VerfasserIn] |
|---|
| | Kumar, Manu P. [VerfasserIn] |
|---|
| | Mereu, Elisabetta [VerfasserIn] |
|---|
| | Joughin, Brian A. [VerfasserIn] |
|---|
| | Stegle, Oliver [VerfasserIn] |
|---|
| | Lauffenburger, Douglas A. [VerfasserIn] |
|---|
| | Heyn, Holger [VerfasserIn] |
|---|
| | Szalai, Bence [VerfasserIn] |
|---|
| | Sáez Rodríguez, Julio [VerfasserIn] |
|---|
| Titel: | Robustness and applicability of transcription factor and pathway analysis tools on single-cell RNA-seq data |
|---|
| Verf.angabe: | Christian H. Holland, Jovan Tanevski, Javier Perales-Patón, Jan Gleixner, Manu P. Kumar, Elisabetta Mereu, Brian A. Joughin, Oliver Stegle, Douglas A. Lauffenburger, Holger Heyn, Bence Szalai and Julio Saez-Rodriguez |
|---|
| E-Jahr: | 2020 |
|---|
| Jahr: | 12 February 2020 |
|---|
| Umfang: | 19 S. |
|---|
| Illustrationen: | Diagramme |
|---|
| Fussnoten: | Gesehen am 02.04.2020 |
|---|
| Titel Quelle: | Enthalten in: Genome biology |
|---|
| Ort Quelle: | London : BioMed Central, 2000 |
|---|
| Jahr Quelle: | 2020 |
|---|
| Band/Heft Quelle: | 21(2020) Artikel-Nummer 36, Seite 1-19, 19 Seiten |
|---|
| ISSN Quelle: | 1474-760X |
|---|
| Abstract: | Many functional analysis tools have been developed to extract functional and mechanistic insight from bulk transcriptome data. With the advent of single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), it is in principle possible to do such an analysis for single cells. However, scRNA-seq data has characteristics such as drop-out events and low library sizes. It is thus not clear if functional TF and pathway analysis tools established for bulk sequencing can be applied to scRNA-seq in a meaningful way. |
|---|
| DOI: | doi:10.1186/s13059-020-1949-z |
|---|
| URL: | Bitte beachten Sie: Dies ist ein Bibliographieeintrag. Ein Volltextzugriff für Mitglieder der Universität besteht hier nur, falls für die entsprechende Zeitschrift/den entsprechenden Sammelband ein Abonnement besteht oder es sich um einen OpenAccess-Titel handelt.
Volltext: https://doi.org/10.1186/s13059-020-1949-z |
|---|
| | DOI: https://doi.org/10.1186/s13059-020-1949-z |
|---|
| Datenträger: | Online-Ressource |
|---|
| Sprache: | eng |
|---|
| K10plus-PPN: | 169380834X |
|---|
| Verknüpfungen: | → Zeitschrift |
|---|
Robustness and applicability of transcription factor and pathway analysis tools on single-cell RNA-seq data / Holland, Christian H. [VerfasserIn]; 12 February 2020 (Online-Ressource)
