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Universitätsbibliothek Heidelberg
Status: Bibliographieeintrag

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 Online-Ressource
Verfasst von:Levering, Jennifer [VerfasserIn]   i
 Fiedler, Tomas [VerfasserIn]   i
 Sieg, Antje [VerfasserIn]   i
 van Grinsven, Koen W. A. [VerfasserIn]   i
 Hering, Silvio [VerfasserIn]   i
 Veith, Nadine [VerfasserIn]   i
 Olivier, Brett G. [VerfasserIn]   i
 Klett, Lara C. [VerfasserIn]   i
 Hugenholtz, Jeroen [VerfasserIn]   i
 Teusink, Bas [VerfasserIn]   i
 Kreikemeyer, Bernd [VerfasserIn]   i
 Kummer, Ursula [VerfasserIn]   i
Titel:Genome-scale reconstruction of the streptococcus pyogenes M49 metabolic network reveals growth requirements and indicates potential drug targets
Verf.angabe:Jennifer Levering, Tomas Fiedler, Antje Sieg, Koen W.A. van Grinsven, Silvio Hering, Nadine Veith, Brett G. Olivier, Lara Klett, Jeroen Hugenholtz, Bas Teusink, Bernd Kreikemeyer, Ursula Kummer
E-Jahr:2016
Jahr:10 March 2016
Umfang:13 S.
Fussnoten:Gesehen am 09.06.2020
Titel Quelle:Enthalten in: Journal of biotechnology
Ort Quelle:Amsterdam [u.a.] : Elsevier Science, 1984
Jahr Quelle:2016
Band/Heft Quelle:232(2016), Seite 25-37
ISSN Quelle:1873-4863
Abstract:Genome-scale metabolic models comprise stoichiometric relations between metabolites, as well as associations between genes and metabolic reactions and facilitate the analysis of metabolism. We computationally reconstructed the metabolic network of the lactic acid bacterium Streptococcus pyogenes M49. Initially, we based the reconstruction on genome annotations and already existing and curated metabolic networks of Bacillus subtilis, Escherichia coli, Lactobacillus plantarum and Lactococcus lactis. This initial draft was manually curated with the final reconstruction accounting for 480 genes associated with 576 reactions and 558 metabolites. In order to constrain the model further, we performed growth experiments of wild type and arcA deletion strains of S. pyogenes M49 in a chemically defined medium and calculated nutrient uptake and production fluxes. We additionally performed amino acid auxotrophy experiments to test the consistency of the model. The established genome-scale model can be used to understand the growth requirements of the human pathogen S. pyogenes and define optimal and suboptimal conditions, but also to describe differences and similarities between S. pyogenes and related lactic acid bacteria such as L. lactis in order to find strategies to reduce the growth of the pathogen and propose drug targets.
DOI:doi:10.1016/j.jbiotec.2016.01.035
URL:Bitte beachten Sie: Dies ist ein Bibliographieeintrag. Ein Volltextzugriff für Mitglieder der Universität besteht hier nur, falls für die entsprechende Zeitschrift/den entsprechenden Sammelband ein Abonnement besteht oder es sich um einen OpenAccess-Titel handelt.

Volltext: https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2016.01.035
 Volltext: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168165616300074
 DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2016.01.035
Datenträger:Online-Ressource
Sprache:eng
Sach-SW:Amino acid auxotrophies
 Genome-scale metabolic model
 Lactic acid bacteria
 Metabolism
K10plus-PPN:1700202529
Verknüpfungen:→ Zeitschrift

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