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Universitätsbibliothek Heidelberg
Status: Bibliographieeintrag

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 Online-Ressource
Verfasst von:Kluesner, Mitchell [VerfasserIn]   i
 Tasakis, Rafail Nikolaos [VerfasserIn]   i
 Lerner, Taga [VerfasserIn]   i
 Zimmer, Annette [VerfasserIn]   i
 Wüst, Sandra [VerfasserIn]   i
 Binder, Marco [VerfasserIn]   i
 Webber, Beau R. [VerfasserIn]   i
 Moriarity, Branden S. [VerfasserIn]   i
 Pecori, Riccardo [VerfasserIn]   i
Titel:MultiEditR
Titelzusatz:the first tool for the detection and quantification of RNA editing from Sanger sequencing demonstrates comparable fidelity to RNA-seq
Verf.angabe:Mitchell G. Kluesner, Rafail Nikolaos Tasakis, Taga Lerner, Annette Arnold, Sandra Wüst, Marco Binder, Beau R. Webber, Branden S. Moriarity, and Riccardo Pecori
E-Jahr:2021
Jahr:21 July 2021
Umfang:9 S.
Fussnoten:Gesehen am 10.11.2021
Titel Quelle:Enthalten in: Molecular Therapy / Nucleic Acids
Ort Quelle:New York, NY : Nature Publ. Group, 2012
Jahr Quelle:2021
Band/Heft Quelle:25(2021), Seite 515-523
ISSN Quelle:2162-2531
Abstract:We present MultiEditR (Multiple Edit Deconvolution by Inference of Traces in R), the first algorithm specifically designed to detect and quantify RNA editing from Sanger sequencing (z.umn.edu/multieditr). Although RNA editing is routinely evaluated by measuring the heights of peaks from Sanger sequencing traces, the accuracy and precision of this approach has yet to be evaluated against gold standard next-generation sequencing methods. Through a comprehensive comparison to RNA sequencing (RNA-seq) and amplicon-based deep sequencing, we show that MultiEditR is accurate, precise, and reliable for detecting endogenous and programmable RNA editing.
DOI:doi:10.1016/j.omtn.2021.07.008
URL:Bitte beachten Sie: Dies ist ein Bibliographieeintrag. Ein Volltextzugriff für Mitglieder der Universität besteht hier nur, falls für die entsprechende Zeitschrift/den entsprechenden Sammelband ein Abonnement besteht oder es sich um einen OpenAccess-Titel handelt.

Volltext ; Verlag: https://doi.org/10.1016/j.omtn.2021.07.008
 Volltext: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2162253121001761
 DOI: https://doi.org/10.1016/j.omtn.2021.07.008
Datenträger:Online-Ressource
Sprache:eng
Sach-SW:ADAR
 APOBEC
 deaminases
 DNA base editing
 Epitranscriptomics
 MultiEditR Editing Index
 RNA editing detection
 RNA editing quantification
 RNA modification
 RShiny
K10plus-PPN:1777169577
Verknüpfungen:→ Zeitschrift

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