| |  Online-Ressource |
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| Verfasst von: | Kluesner, Mitchell [VerfasserIn]  |
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| | Tasakis, Rafail Nikolaos [VerfasserIn] |
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| | Lerner, Taga [VerfasserIn] |
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| | Zimmer, Annette [VerfasserIn] |
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| | Wüst, Sandra [VerfasserIn] |
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| | Binder, Marco [VerfasserIn] |
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| | Webber, Beau R. [VerfasserIn] |
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| | Moriarity, Branden S. [VerfasserIn] |
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| | Pecori, Riccardo [VerfasserIn] |
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| Titel: | MultiEditR |
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| Titelzusatz: | the first tool for the detection and quantification of RNA editing from Sanger sequencing demonstrates comparable fidelity to RNA-seq |
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| Verf.angabe: | Mitchell G. Kluesner, Rafail Nikolaos Tasakis, Taga Lerner, Annette Arnold, Sandra Wüst, Marco Binder, Beau R. Webber, Branden S. Moriarity, and Riccardo Pecori |
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| E-Jahr: | 2021 |
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| Jahr: | 21 July 2021 |
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| Umfang: | 9 S. |
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| Fussnoten: | Gesehen am 10.11.2021 |
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| Titel Quelle: | Enthalten in: Molecular Therapy / Nucleic Acids |
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| Ort Quelle: | New York, NY : Nature Publ. Group, 2012 |
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| Jahr Quelle: | 2021 |
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| Band/Heft Quelle: | 25(2021), Seite 515-523 |
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| ISSN Quelle: | 2162-2531 |
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| Abstract: | We present MultiEditR (Multiple Edit Deconvolution by Inference of Traces in R), the first algorithm specifically designed to detect and quantify RNA editing from Sanger sequencing (z.umn.edu/multieditr). Although RNA editing is routinely evaluated by measuring the heights of peaks from Sanger sequencing traces, the accuracy and precision of this approach has yet to be evaluated against gold standard next-generation sequencing methods. Through a comprehensive comparison to RNA sequencing (RNA-seq) and amplicon-based deep sequencing, we show that MultiEditR is accurate, precise, and reliable for detecting endogenous and programmable RNA editing. |
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| DOI: | doi:10.1016/j.omtn.2021.07.008 |
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| URL: | Bitte beachten Sie: Dies ist ein Bibliographieeintrag. Ein Volltextzugriff für Mitglieder der Universität besteht hier nur, falls für die entsprechende Zeitschrift/den entsprechenden Sammelband ein Abonnement besteht oder es sich um einen OpenAccess-Titel handelt.
Volltext ; Verlag: https://doi.org/10.1016/j.omtn.2021.07.008 |
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| | Volltext: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2162253121001761 |
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| | DOI: https://doi.org/10.1016/j.omtn.2021.07.008 |
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| Datenträger: | Online-Ressource |
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| Sprache: | eng |
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| Sach-SW: | ADAR |
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| | APOBEC |
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| | deaminases |
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| | DNA base editing |
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| | Epitranscriptomics |
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| | MultiEditR Editing Index |
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| | RNA editing detection |
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| | RNA editing quantification |
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| | RNA modification |
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| | RShiny |
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| K10plus-PPN: | 1777169577 |
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| Verknüpfungen: | → Zeitschrift |
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