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Universitätsbibliothek Heidelberg
Status: Bibliographieeintrag

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 Online-Ressource
Verfasst von:Dreher, Yannik [VerfasserIn]   i
 Fichtler, Julius [VerfasserIn]   i
 Karfusehr, Christoph [VerfasserIn]   i
 Jahnke, Kevin [VerfasserIn]   i
 Xin, Yang [VerfasserIn]   i
 Keller, Adrian [VerfasserIn]   i
 Göpfrich, Kerstin [VerfasserIn]   i
Titel:Genotype-phenotype mapping with polyominos made from DNA origami tiles
Verf.angabe:Yannik Dreher, Julius Fichtler, Christoph Karfusehr, Kevin Jahnke, Yang Xin, Adrian Keller and Kerstin Göpfrich
E-Jahr:2022
Jahr:20 December 2022
Umfang:9 S.
Fussnoten:Online veröffentlicht: 10. September 2022, Artikelversion: 20. Dezember 2022 ; Gesehen am 20.02.2023
Titel Quelle:Enthalten in: Biophysical journal
Ort Quelle:Cambridge, Mass. : Cell Press, 1960
Jahr Quelle:2022
Band/Heft Quelle:121(2022), 24, Seite 4840-4848
ISSN Quelle:1542-0086
Abstract:The correlation between genetic information and characteristics of a living cell - its genotype and its phenotype - constitutes the basis of genetics. Here, we experimentally realize a primitive form of genotype-phenotype mapping with DNA origami. The DNA origami can polymerize into two-dimensional lattices (phenotype) via blunt-end stacking facilitated by edge staples at the seam of the planar DNA origami. There are 80 binding positions for edge staples, which allow us to translate an 80-bit long binary code (genotype) onto the DNA origami. The presence of an edge staple thus corresponds to a ‘‘1’’ and its absence to a ‘‘0.’’ The interactions of our DNA-based system can be reproduced by a polyomino model. Polyomino growth simulations qualitatively reproduce our experimental results. We show that not only the absolute number of base stacks but also their sequence position determine the cluster size and correlation length of the orientation of single DNA origami within the cluster. Importantly, the mutation of a few bits can result in major morphology changes of the DNA origami cluster, while more often, major sequence changes have no impact. Our experimental realization of a correlation between binary information (‘‘genotype’’) and cluster morphology (‘‘phenotype’’) thus reproduces key properties of genotype-phenotype maps known from living systems.
DOI:doi:10.1016/j.bpj.2022.09.006
URL:Bitte beachten Sie: Dies ist ein Bibliographieeintrag. Ein Volltextzugriff für Mitglieder der Universität besteht hier nur, falls für die entsprechende Zeitschrift/den entsprechenden Sammelband ein Abonnement besteht oder es sich um einen OpenAccess-Titel handelt.

Volltext: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2022.09.006
 Volltext: https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0006349522007342
 DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2022.09.006
Datenträger:Online-Ressource
Sprache:eng
K10plus-PPN:1837127115
Verknüpfungen:→ Zeitschrift

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