Navigation überspringen
Universitätsbibliothek Heidelberg
Status: Bibliographieeintrag

Verfügbarkeit
Standort: ---
Exemplare: ---
heiBIB
 Online-Ressource
Verfasst von:Kirchner, Marc [VerfasserIn]   i
 Renard, Bernhard Y. [VerfasserIn]   i
 Köthe, Ullrich [VerfasserIn]   i
 Pappin, Darryl J. [VerfasserIn]   i
 Hamprecht, Fred [VerfasserIn]   i
 Steen, Hanno [VerfasserIn]   i
 Steen, Judith A. J. [VerfasserIn]   i
Titel:Computational protein profile similarity screening for quantitative mass spectrometry experiments
Verf.angabe:Marc Kirchner, Bernhard Y. Renard, Ullrich Köthe, Darryl J. Pappin, Fred A. Hamprecht, Hanno Steen and Judith A.J. Steen
Jahr:2010
Umfang:7 S.
Fussnoten:Online veröffentlicht am 27. Oktober 2009 ; Gesehen am 14.03.2023
Titel Quelle:Enthalten in: Bioinformatics
Ort Quelle:Oxford : Oxford Univ. Press, 1985
Jahr Quelle:2010
Band/Heft Quelle:26(2010), 1 vom: Jan., Seite 77-83
ISSN Quelle:1367-4811
Abstract:The qualitative and quantitative characterization of protein abundance profiles over a series of time points or a set of environmental conditions is becoming increasingly important. Using isobaric mass tagging experiments, mass spectrometry-based quantitative proteomics deliver accurate peptide abundance profiles for relative quantitation. Associated data analysis workflows need to provide tailored statistical treatment that (i) takes the correlation structure of the normalized peptide abundance profiles into account and (ii) allows inference of protein-level similarity. We introduce a suitable distance measure for relative abundance profiles, derive a statistical test for equality and propose a protein-level representation of peptide-level measurements. This yields a workflow that delivers a similarity ranking of protein abundance profiles with respect to a defined reference. All procedures have in common that they operate based on the true correlation structure that underlies the measurements. This optimizes power and delivers more intuitive and efficient results than existing methods that do not take these circumstances into account.
DOI:doi:10.1093/bioinformatics/btp607
URL:Bitte beachten Sie: Dies ist ein Bibliographieeintrag. Ein Volltextzugriff für Mitglieder der Universität besteht hier nur, falls für die entsprechende Zeitschrift/den entsprechenden Sammelband ein Abonnement besteht oder es sich um einen OpenAccess-Titel handelt.

Volltext: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp607
 Volltext: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/26/1/77/181891
 DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp607
Datenträger:Online-Ressource
Sprache:eng
K10plus-PPN:1839089113
Verknüpfungen:→ Zeitschrift

Permanenter Link auf diesen Titel (bookmarkfähig):  https://katalog.ub.uni-heidelberg.de/titel/69051484   QR-Code
zum Seitenanfang