| |  Online-Ressource |
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| Verfasst von: | Seyfferth, Carolin [VerfasserIn]  |
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| | Eekhout, Thomas [VerfasserIn] |
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| | Shi, Dongbo [VerfasserIn] |
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| | Neumann, Manuel [VerfasserIn] |
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| | Berg, Lea S [VerfasserIn] |
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| | Ke, Yuji [VerfasserIn] |
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| | Shahan, Rachel [VerfasserIn] |
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| | Cox, Kevin L, Jr [VerfasserIn] |
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| | Gomez-Cano, Fabio [VerfasserIn] |
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| | Nelissen, Hilde [VerfasserIn] |
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| | Lohmann, Jan U. [VerfasserIn] |
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| | Giacomello, Stefania [VerfasserIn] |
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| | Martin, Olivier C [VerfasserIn] |
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| | Cole, Benjamin [VerfasserIn] |
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| | Wang, Jia-Wei [VerfasserIn] |
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| | Kaufmann, Kerstin [VerfasserIn] |
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| | Raissig, Michael T [VerfasserIn] |
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| | Palfalvi, Gergo [VerfasserIn] |
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| | Greb, Thomas [VerfasserIn] |
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| | Libault, Marc [VerfasserIn] |
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| | De Rybel, Bert [VerfasserIn] |
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| Titel: | Best practices for the execution, analysis, and data storage of plant single-cell/nucleus transcriptomics |
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| Verf.angabe: | Carolin Grones, Thomas Eekhout, Dongbo Shi, Manuel Neumann, Lea S. Berg, Yuji Ke, Rachel Shahan, Kevin L. Cox Jr, Fabio Gomez-Cano, Hilde Nelissen, Jan U. Lohmann, Stefania Giacomello, Olivier C. Martin, Benjamin Cole, Jia-Wei Wang, Kerstin Kaufmann, Michael T. Raissig, Gergo Palfalvi, Thomas Greb, Marc Libault and Bert De Rybel |
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| E-Jahr: | 2024 |
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| Jahr: | April 2024 |
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| Umfang: | 17 S. |
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| Illustrationen: | Illustrationen |
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| Fussnoten: | Veröffentlicht: 17. Januar 2024 ; Gesehen am 01.07.2024 |
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| Titel Quelle: | Enthalten in: The plant cell |
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| Ort Quelle: | Rockville, Md. : Soc., 1989 |
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| Jahr Quelle: | 2024 |
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| Band/Heft Quelle: | 36(2024), 4 vom: Apr., Seite 812-828 |
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| ISSN Quelle: | 1532-298X |
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| Abstract: | Single-cell and single-nucleus RNA-sequencing technologies capture the expression of plant genes at an unprecedented resolution. Therefore, these technologies are gaining traction in plant molecular and developmental biology for elucidating the transcriptional changes across cell types in a specific tissue or organ, upon treatments, in response to biotic and abiotic stresses, or between genotypes. Despite the rapidly accelerating use of these technologies, collective and standardized experimental and analytical procedures to support the acquisition of high-quality data sets are still missing. In this commentary, we discuss common challenges associated with the use of single-cell transcriptomics in plants and propose general guidelines to improve reproducibility, quality, comparability, and interpretation and to make the data readily available to the community in this fast-developing field of research. |
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| DOI: | doi:10.1093/plcell/koae003 |
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| URL: | Bitte beachten Sie: Dies ist ein Bibliographieeintrag. Ein Volltextzugriff für Mitglieder der Universität besteht hier nur, falls für die entsprechende Zeitschrift/den entsprechenden Sammelband ein Abonnement besteht oder es sich um einen OpenAccess-Titel handelt.
kostenfrei: Volltext: https://doi.org/10.1093/plcell/koae003 |
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| | DOI: https://doi.org/10.1093/plcell/koae003 |
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| Datenträger: | Online-Ressource |
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| Sprache: | eng |
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| K10plus-PPN: | 1892778319 |
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| Verknüpfungen: | → Zeitschrift |
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Best practices for the execution, analysis, and data storage of plant single-cell/nucleus transcriptomics / Seyfferth, Carolin [VerfasserIn]; April 2024 (Online-Ressource)
