| |  Online-Ressource |
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| Verfasst von: | Sollier, Etienne [VerfasserIn]  |
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| | Heilmann, Jessica [VerfasserIn] |
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| | Gerhäuser, Clarissa [VerfasserIn] |
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| | Scherer, Michael [VerfasserIn] |
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| | Plass, Christoph [VerfasserIn] |
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| | Lutsik, Pavlo [VerfasserIn] |
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| Titel: | Figeno |
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| Titelzusatz: | multi-region genomic figures with long-read support |
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| Verf.angabe: | Etienne Sollier, Jessica Heilmann, Clarissa Gerhauser, Michael Scherer, Christoph Plass, Pavlo Lutsik |
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| E-Jahr: | 2024 |
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| Jahr: | June 2024 |
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| Umfang: | 4 S. |
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| Illustrationen: | Illustrationen |
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| Fussnoten: | Veröffentlicht: 10. Juni 2024 ; Gesehen am 21.11.2024 |
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| Titel Quelle: | Enthalten in: Bioinformatics |
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| Ort Quelle: | Oxford : Oxford Univ. Press, 1998 |
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| Jahr Quelle: | 2024 |
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| Band/Heft Quelle: | 40(2024), 6 vom: Juni, Artikel-ID btae354, Seite 1-4 |
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| ISSN Quelle: | 1367-4811 |
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| Abstract: | The vast amount of publicly available genomic data requires analysis and visualization tools. Here, we present figeno, an application for generating publication-quality FIgures for GENOmics. Figeno particularly focuses on multi-region views across genomic breakpoints and on long reads with base modifications. In addition, we support epigenomic data including ATAC-seq, ChIP-seq or HiC, as well as whole genome sequencing data with copy numbers and structural variants.Figeno is available as a python package with both a command line and graphical user interface. It can be installed via PyPI and the source code is available at https://github.com/CompEpigen/figeno. |
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| DOI: | doi:10.1093/bioinformatics/btae354 |
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| URL: | Bitte beachten Sie: Dies ist ein Bibliographieeintrag. Ein Volltextzugriff für Mitglieder der Universität besteht hier nur, falls für die entsprechende Zeitschrift/den entsprechenden Sammelband ein Abonnement besteht oder es sich um einen OpenAccess-Titel handelt.
kostenfrei: Volltext: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btae354 |
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| | DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btae354 |
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| Datenträger: | Online-Ressource |
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| Sprache: | eng |
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| K10plus-PPN: | 1909306363 |
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| Verknüpfungen: | → Zeitschrift |
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