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Universitätsbibliothek Heidelberg
Status: Bibliographieeintrag

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 Online-Ressource
Verfasst von:Scheuermann, Stefan [VerfasserIn]   i
 Hücker, Sarah [VerfasserIn]   i
 Engel, Annika [VerfasserIn]   i
 Ludwig, Nicole [VerfasserIn]   i
 Lebhardt, Philipp [VerfasserIn]   i
 Langejürgen, Jens [VerfasserIn]   i
 Kirsch, Stefan [VerfasserIn]   i
Titel:A novel approach to generate enzyme-free single cell suspensions from archived tissues for miRNA sequencing
Verf.angabe:Stefan Scheuermann, Sarah Hücker, Annika Engel, Nicole Ludwig, Philipp Lebhardt, Jens Langejürgen, Stefan Kirsch
E-Jahr:2024
Jahr:June 2024
Umfang:7 S.
Illustrationen:Illustrationen
Fussnoten:Online verfügbar: 6. April 2024, Artikelversion: 8. Juni 2024 ; Gesehen am 21.01.2025
Titel Quelle:Enthalten in: SLAS technology
Ort Quelle:Amsterdam : Elsevier, 2016
Jahr Quelle:2024
Band/Heft Quelle:29(2024), 3, Artikel-ID 100133, Seite 1-7
ISSN Quelle:2472-6311
Abstract:Obtaining high-quality omics data at the single-cell level from archived human tissue samples is crucial for gaining insights into cellular heterogeneity and pushing the field of personalized medicine forward. In this technical brief we present a comprehensive methodological framework for the efficient enzyme-free preparation of tissue-derived single cell suspensions and their conversion into single-cell miRNA sequencing libraries. The resulting data from this study have the potential to deepen our understanding of miRNA expression at the single-cell level and its relevance in the context of the examined tissues. The workflow encompasses tissue collection, RNALater immersion, storage, thawing, TissueGrinder-mediated dissociation, miRNA lysis, library preparation, sequencing, and data analysis. Quality control measures ensure reliable miRNA data, with specific attention to sample quality. The UMAP analysis reveals tissue-specific cell clustering, while miRNA diversity reflects tissue variations. The presented workflow effectively processes preserved tissues, extending opportunities for retrospective analysis and biobank utilization.
DOI:doi:10.1016/j.slast.2024.100133
URL:Bitte beachten Sie: Dies ist ein Bibliographieeintrag. Ein Volltextzugriff für Mitglieder der Universität besteht hier nur, falls für die entsprechende Zeitschrift/den entsprechenden Sammelband ein Abonnement besteht oder es sich um einen OpenAccess-Titel handelt.

kostenfrei: Volltext: https://doi.org/10.1016/j.slast.2024.100133
 kostenfrei: Volltext: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2472630324000153
 DOI: https://doi.org/10.1016/j.slast.2024.100133
Datenträger:Online-Ressource
Sprache:eng
Sach-SW:Micro RNAs (miRNA) sequencing
 Molecular characterization
 Personalized medicine
 Single-cell analysis, Enzyme-free tissue dissociation
K10plus-PPN:1915200369
Verknüpfungen:→ Zeitschrift

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