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Universitätsbibliothek Heidelberg
Status: Bibliographieeintrag

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 Online-Ressource
Verfasst von:Ramakrishnan, Vignesh [VerfasserIn]   i
 Artinger, Annalena [VerfasserIn]   i
 Daza Barragan, Laura Alexandra [VerfasserIn]   i
 Daza Barragán, Jimmy Andres [VerfasserIn]   i
 Winter, Lina [VerfasserIn]   i
 Niedermair, Tanja [VerfasserIn]   i
 Itzel, Timo [VerfasserIn]   i
 Arbelaez, Pablo [VerfasserIn]   i
 Teufel, Andreas [VerfasserIn]   i
 López-Cotarelo Rodríguez-Noriega, Cristina [VerfasserIn]   i
 Brochhausen, Christoph [VerfasserIn]   i
Titel:Nuclei Detection and Segmentation of Histopathological Images Using a Feature Pyramidal Network Variant of a Mask R-CNN
Verf.angabe:Vignesh Ramakrishnan, Annalena Artinger, Laura Alexandra Daza Barragan, Jimmy Daza, Lina Winter, Tanja Niedermair, Timo Itzel, Pablo Arbelaez, Andreas Teufel, Cristina L. Cotarelo and Christoph Brochhausen
E-Jahr:2024
Jahr:1 October 2024
Umfang:13 S.
Illustrationen:Illustrationen
Fussnoten:Gesehen am 02.04.2025
Titel Quelle:Enthalten in: Bioengineering
Ort Quelle:Basel : MDPI, 2014
Jahr Quelle:2024
Band/Heft Quelle:11(2024), 10, Artikel-ID 994, Seite 1-13
ISSN Quelle:2306-5354
Abstract:Cell nuclei interpretation is crucial in pathological diagnostics, especially in tumor specimens. A critical step in computational pathology is to detect and analyze individual nuclear properties using segmentation algorithms. Conventionally, a semantic segmentation network is used, where individual nuclear properties are derived after post-processing a segmentation mask. In this study, we focus on showing that an object-detection-based instance segmentation network, the Mask R-CNN, after integrating it with a Feature Pyramidal Network (FPN), gives mature and reliable results for nuclei detection without the need for additional post-processing. The results were analyzed using the Kumar dataset, a public dataset with over 20,000 nuclei annotations from various organs. The dice score of the baseline Mask R-CNN improved from 76% to 83% after integration with an FPN. This was comparable with the 82.6% dice score achieved by modern semantic-segmentation-based networks. Thus, evidence is provided that an end-to-end trainable detection-based instance segmentation algorithm with minimal post-processing steps can reliably be used for the detection and analysis of individual nuclear properties. This represents a relevant task for research and diagnosis in digital pathology, which can improve the automated analysis of histopathological images.
DOI:doi:10.3390/bioengineering11100994
URL:Bitte beachten Sie: Dies ist ein Bibliographieeintrag. Ein Volltextzugriff für Mitglieder der Universität besteht hier nur, falls für die entsprechende Zeitschrift/den entsprechenden Sammelband ein Abonnement besteht oder es sich um einen OpenAccess-Titel handelt.

kostenfrei: Volltext: https://doi.org/10.3390/bioengineering11100994
 kostenfrei: Volltext: https://www.mdpi.com/2306-5354/11/10/994
 DOI: https://doi.org/10.3390/bioengineering11100994
Datenträger:Online-Ressource
Sprache:eng
Sach-SW:artificial intelligence
 digital pathology
 histopathology
 Mask R-CNN
 nuclei detection
K10plus-PPN:1921160535
Verknüpfungen:→ Zeitschrift

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