Gunkel, Manuel Dr.Universität HeidelbergHeidelberg
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Publications in heiBIB 
- Zhang, Jian: High-content analysis of microRNAs involved in the phenotype regulation of vascular smooth muscle cells / Jian Zhang, Vytaute Starkuviene, Holger Erfle, Zhaohui Wang, Manuel Gunkel, Ziwei Zeng, Carsten Stic… , 03 März 2022. - 14 S.
In: Scientific reports, ISSN 2045-2322. 12(2022), Artikel-ID 3498, Seite 1-14
DOI: 10.1038/s41598-022-07280-7
- Zhang, Cindy: An RNA interference/adeno-associated virus vector-based combinatorial gene therapy approach against Hepatitis E Virus / Cindy Zhang, Andrew Freistaedter, Carolin Schmelas, Manuel Gunkel, Viet Loan Dao Thi, and Dirk Grimm, 2022. - 11 S.
In: Hepatology communications, ISSN 2471-254X. 6(2022), 4, Seite 878-888
DOI: 10.1002/hep4.1842
- Wang, Zhaohui: MicroRNAs influence the migratory ability of human umbilical vein endothelial cells / Zhaohui Wang, Ziwei Zeng, Vytaute Starkuviene, Holger Erfle, Kejia Kan, Jian Zhang, Manuel Gunkel, C… , 2 April 2022. - 13 S.
In: Genes, ISSN 2073-4425. 13(2022), 4 vom: Apr., Artikel-ID 640, Seite 1-13
DOI: 10.3390/genes13040640
- Poos, Alexandra: PITX1 is a regulator of TERT expression in prostate cancer with prognostic power / Alexandra M. Poos, Cornelia Schroeder, Neeraja Jaishankar, Daniela Röll, Marcus Oswald, Jan Meiners,… , 1 March 2022. - 23 S.
In: Cancers, ISSN 2072-6694. 14(2022), 5, Artikel-ID 1267, Seite -23
DOI: 10.3390/cancers14051267
- Starkuviene-Erfle, Vytaute: High-density cell arrays for genome-scale phenotypic screening / Vytaute Starkuviene, Stefan M. Kallenberger, Nina Beil, Tautvydas Lisauskas, Bastian So-Song Schumac… . -
Thousand Oaks, Calif.: Sage, 2019. - 1 Online-Ressource
DOI: 10.11588/heidok.00028444
- Ritter, Christian: Hyperparameter optimization for image analysis : application to prostate tissue images and live cell data of virus-infected cells / Christian Ritter, Thomas Wollmann, Patrick Bernhard, Manuel Gunkel, Delia M. Braun, Ji-Young Lee, Ja… , 8 June 2019. - 11 S.
In: International journal of computer assisted radiology and surgery, ISSN 1861-6429. 14(2019), 11, Seite 1847-1857
DOI: 10.1007/s11548-019-02010-3
- Wollmann, Thomas: GRUU-Net : Integrated convolutional and gated recurrent neural network for cell segmentation / T. Wollmann, M. Gunkel, I. Chung, H. Erfle, K. Rippe, K. Rohr, 31 May 2019. - 12 S.
In: Medical image analysis, ISSN 1361-8423. 56(2019), Seite 68-79
DOI: 10.1016/j.media.2019.04.011
- Starkuviene-Erfle, Vytaute: High-density cell arrays for genome-scale phenotypic screening / Vytaute Starkuviene, Stefan M. Kallenberger, Nina Beil, Tautvydas Lisauskas, Bastian So-Song Schumac… , January 25, 2019. - 10 S.
In: SLAS discovery, ISSN 2472-5560. 24(2019), 3, Seite 274-283
DOI: 10.1177/2472555218818757
- Herrmann, Anne-Kathrin: Impact of the assembly-activating protein on molecular evolution of synthetic adeno-associated virus capsids / Anne-Katrhin Herrmann, Stefanie Große, Kathleen Börner, Chiara Krämer, Ellen Wiedtke, Manuel Gunkel,… , 10 Jan 2019. - 15 S.
In: Human gene therapy, ISSN 1557-7422. 30(2019), 1, Seite 21-35
DOI: 10.1089/hum.2018.085
- Becker, Ann-Kristin: Comparison of cell arrays and multi-well plates in microscopy-based screening / Ann-Kristin Becker, Holger Erfle, Manuel Gunkel, Nina Beil, Lars Kaderali and Vytaute Starkuviene, 15 May 2018. - 15 S.
In: High-throughput, ISSN 2571-5135. 7(2018,2) Artikel-Nummer 13, 15 Seiten
DOI: 10.3390/ht7020013
- Rippe, Karsten: Schlussbericht zum e:Med - Modul I - Verbundprojekt "CancerTelSys - Identifizierung von Netzwerken für die Telomererhaltung in Tumoren zur Diagnose, Prognose, Patientenstratifizierung und Vorhersage der Therapieantwort" : Laufzeit des Vorhabens: 1.3.2014-28.2.2017 / Zuwendungsempfänger: Deutsches Krebsforschungszentrum DKFZ, Heidelberg; Universitätsklinikum Jena; U… . -
[Heidelberg]: [Deutsches Krebsforschungszentrum DKFZ], [2017?]. - 1 Online-Ressource (39 Seiten, 351 KB)
DOI: 10.2314/GBV:1017756007
- Rippe, Karsten: Schlussbericht zum e:Med - Modul I - Verbundprojekt "CancerTelSys - Identifizierung von Netzwerken für die Telomererhaltung in Tumoren zur Diagnose, Prognose, Patientenstratifizierung und Vorhersage der Therapieantwort" : Laufzeit des Vorhabens: 1.3.2014-28.2.2017 / Zuwendungsempfänger: Deutsches Krebsforschungszentrum DKFZ, Heidelberg; Universitätsklinikum Jena; U… . -
[Heidelberg]: [Deutsches Krebsforschungszentrum DKFZ], [2017?]. - 38 Blätter, 1 ungezähltes Blatt
- Wollmann, Thomas: Workflows for microscopy image analysis and cellular phenotyping / Thomas Wollmann, Holger Erfle, Roland Eils, Karl Rohr, Manuel Gunkel. - 6 S.
In: Journal of biotechnology, ISSN 1873-4863. 261(2017), S. 70-75
DOI: 10.1016/j.jbiotec.2017.07.019
- Nötzold, Linda: The long non-coding RNA LINC00152 is essential for cell cycle progression through mitosis in HeLa cells / Linda Nötzold, Lukas Frank, Minakshi Gandhi, Maria Polycarpou-Schwarz, Matthias Groß, Manuel Gunkel,… , 23 May 2017. - 13 S.
In: Scientific reports, ISSN 2045-2322. 7(2017) Artikel-Nummer 2265, 13 Seiten
DOI: 10.1038/s41598-017-02357-0
- Eberle, Jan Philipp: Fully automated targeted confocal and single-molecule localization microscopy / Jan Philipp Eberle, Walter Muranyi, Holger Erfle, Manuel Gunkel, 2017. - 14 S.
In: Super-resolution microscopy. (2017), Seite 139-152
DOI: 10.1007/978-1-4939-7265-4_12
- Eberle, Jan Philipp: Super-resolution microscopy techniques and their potential for applications in radiation biophysics / Jan Philipp Eberle, Alexander Rapp, Matthias Krufczik, Marion Eryilmaz, Manuel Gunkel, Holger Erfle,… , 2017. - 13 S.
In: Super-resolution microscopy. (2017), Seite 1-13
DOI: 10.1007/978-1-4939-7265-4_1
- Gunkel, Manuel: Fluorescence-based high-throughput and targeted image acquisition and analysis for phenotypic screening / Manuel Gunkel, Jan Philipp Eberle, Holger Erfle. - 12 S.
In: Light Microscopy. (2017), S. 269-280
DOI: 10.1007/978-1-4939-6810-7_17
- Gunkel, Manuel: Quantification of telomere features in tumor tissue sections by an automated 3D imaging-based workflow / Manuel Gunkel, Inn Chung, Stefan Wörz, Katharina I. Deeg, Ronald Simon, Guido Sauter, David T. W. Jo… , 7 October 2016. - 14 S.
In: Methods, ISSN 1095-9130. 114(2017), Seite 60-73
DOI: 10.1016/j.ymeth.2016.09.014
- Große, Stefanie: Relevance of assembly-activating protein for adeno-associated virus vector production and capsid protein stability in mammalian and insect cells / Stefanie Grosse, Magalie Penaud-Budloo, Anne-Kathrin Herrmann, Kathleen Börner, Julia Fakhiri, Vibor… , 2017. - 20 S.
In: Journal of virology, ISSN 1098-5514. 91(2017,20) Artikel-Nummer e01198-17, 20 Seiten
DOI: 10.1128/JVI.01198-17
- Pilarczyk, Götz: Localisation microscopy of breast epithelial ErbB-2 receptors and gap junctions : trafficking after γ-irradiation, neuregulin-1β, and trastuzumab application / Götz Pilarczyk, Ines Nesnidal, Manuel Gunkel, Margund Bach, Felix Bestvater and Michael Hausmann
In: International journal of molecular sciences, ISSN 1422-0067. 18(2017) Artikel-Nummer 362, 28 Seiten
DOI: 10.3390/ijms18020362
- Pilarczyk, Götz: Tissue-mimicking geometrical constraints stimulate tissue-like constitution and activity of mouse neonatal and human-induced pluripotent stem cell-derived cardiac myocytes / Götz Pilarczyk, Alexandra Raulf, Manuel Gunkel, Bernd K. Fleischmann, Robert Lemor and Michael Hausm… , 7 January 2016. - 22 S.
In: Journal of Functional Biomaterials, ISSN 2079-4983. 7(2016,1) Artikel-Nummer 1, 22 Seiten
DOI: 10.3390/jfb7010001
- Gunkel, Manuel: Fluorescence microscopy-based RNA interference screening / Manuel Gunkel, Nina Beil, Jürgen Beneke, Jürgen Reymann, Holger Erfle, 2015. - 8 S.
In: Advanced fluorescence microscopy. (2015), Seite 59-66
DOI: 10.1007/978-1-4939-2080-8_4
- Cremer, Christoph: Application perspectives of localization microscopy in virology / C. Cremer, R. Kaufmann, M. Gunkel, F. Polanski, P. Müller, R. Dierkes, S. Degenhard, C. Wege, M. Hau… , 11 March 2014. - 17 S.
In: Histochemistry and cell biology, ISSN 1432-119X. 142(2014), 1, Seite 43-59
DOI: 10.1007/s00418-014-1203-4
- Gunkel, Manuel: Integrated and correlative high-throughput and super-resolution microscopy / Manuel Gunkel, Benjamin Flottmann, Mike Heilemann, Jürgen Reymann, Holger Erfle, 20 March 2014. - 7 S.
In: Histochemistry and cell biology, ISSN 1432-119X. 141(2014), 6, Seite 597-603
DOI: 10.1007/s00418-014-1209-y
- Müller, Patrick: Spatial distribution and structural arrangement of a murine cytomegalovirus glycoprotein detected by SPDM localization microscopy / Patrick Müller, Niels A. Lemmermann, Rainer Kaufmann, Manuel Gunkel, Daniel Paech, Georg Hildenbrand… , July 2014. - 7 S.
In: Histochemistry and cell biology, ISSN 1432-119X. 142(2014), 1, Seite 61-67
DOI: 10.1007/s00418-014-1185-2
- Flottmann, Benjamin: Correlative light microscopy for high-content screening / Benjamin Flottmann, Manuel Gunkel, Tautvydas Lisauskas, Mike Heilemann, Vytaute Starkuviene, Jürgen … , November 1, 2013. - 10 S.
In: BioTechniques, ISSN 1940-9818. 55(2013), 5, Seite 243-252
DOI: 10.2144/000114099
- Cremer, Christoph: Superresolution imaging of biological nanostructures by spectral precision distance microscopy / Christoph Cremer, Rainer Kaufmann, Manuel Gunkel, Sebastian Pres, Yanina Weiland, Patrick Müller, Th… , 09 September 2011. - 15 S.
In: Biotechnology journal, ISSN 1860-7314. 6(2011), 9, Seite 1037-1051
DOI: 10.1002/biot.201100031
- Bohn, Manfred: Localization microscopy reveals expression-dependent parameters of chromatin nanostructures / Manfred Bohn ... Rainer Kaufmann ... Patrick Müller, Manuel Gunkel ... Michael Hausmann, Dieter W. H… , 2010. - 10 S.
In: Biophysical journal, ISSN 1542-0086. 99(2010), 5, Seite 1358-1367
DOI: 10.1016/j.bpj.2010.05.043
