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Publikationen in heiBIB     

• Okonechnikov, Konstantin: Oncogene aberrations drive medulloblastoma progression, not initiation / Konstantin Okonechnikov, Piyush Joshi, Verena Körber, Anne Rademacher, Michele Bortolomeazzi, Jan-Ph… , 07 May 2025. - 34 S.
  In: Nature, ISSN 1476-4687. (2025), Seite 1-11, [1-13]
  DOI: 10.1038/s41586-025-08973-5
• Olmo Somolinos, Marta del: Network switches and their role in circadian clocks / Marta Del Olmo, Stefan Legewie, Michael Brunner, Thomas Höfer, Achim Kramer, Nils Blüthgen, and Hans… , 22 March 2024. - 15 S.
  In: The journal of biological chemistry, ISSN 1083-351X. 300(2024), 5 vom: Mai, Artikel-ID 107220, Seite 1-15
  DOI: 10.1016/j.jbc.2024.107220
• Hegazy, Ahmed Nabil: Plasticity and lineage commitment of individual TH1 cells are determined by stable T-bet expression quantities / Ahmed N. Hegazy, Caroline Peine, Dominik Niesen, Isabel Panse, Yevhen Vainshtein, Christoph Kommer, … , June 7, 2024. - 15 S.
  In: Science advances, ISSN 2375-2548. 10(2024), 23 vom: Juni, Artikel-ID eadk2693, Seite 1-15
  DOI: 10.1126/sciadv.adk2693
• Brunner, Tobias Michael: A type 1 immunity-restricted promoter of the IL−33 receptor gene directs antiviral T-cell responses / Tobias M. Brunner, Sebastian Serve, Anna-Friederike Marx, Jelizaveta Fadejeva, Philippe Saikali, Mar… , 03 January 2024. - 36 S. : Illustrationen
  In: Nature immunology, ISSN 1529-2916. 12 gezählte sowie 24 ungezählte Seiten
  DOI: 10.1038/s41590-023-01697-6
• Küchenhoff, Leonie: Extended methods for spatial cell classification with DBSCAN-CellX / Leonie Küchenhoff, Pascal Lukas, Camila Metz-Zumaran, Paul Rothhaar, Alessia Ruggieri, Volker Lohman… , 01 November 2023. - 11 S.
  In: Scientific reports, ISSN 2045-2322. 13(2023), Artikel-ID 18868, Seite 1-11
  DOI: 10.1038/s41598-023-45190-4
• Sacirbegovic, Faruk: Graft-versus-host disease is locally maintained in target tissues by resident progenitor-like T cells / Faruk Sacirbegovic, Matthias Günther, Alessandro Greco, Daqiang Zhao, Xi Wang, Meng Zhou, Sarah Rose… , 14 February 2023. - 23 S.
  In: Immunity, ISSN 1097-4180. 56(2023), 2 vom: Feb., Seite 369-385, e1-e6
  DOI: 10.1016/j.immuni.2023.01.003
• Fatti, Edoardo: DEAD box RNA helicases act as nucleotide exchange factors for casein kinase 2 / Edoardo Fatti, Alexander Hirth, Andrea Švorinić, Matthias Günther, Gunter Stier, Cristina-Maria Cruc… , 25 Apr 2023. - ?
  In: Science signaling, ISSN 1937-9145. 16(2023), 782, Artikel-ID eabp8923, Seite ?
  DOI: 10.1126/scisignal.abp8923
• Nizharadze, Tamar: Quantitating CD8+ T cell memory development / Tamar Nizharadze, Nils B. Becker, and Thomas Höfer, July 2023. - 11 S. : Illustrationen
  In: Trends in immunology, ISSN 1471-4981. 44(2023), 7 vom: Juli, Seite 519-529
  DOI: 10.1016/j.it.2023.05.004
• Fanti, Ann-Kathrin: Flt3- and Tie2-Cre tracing identifies regeneration in sepsis from multipotent progenitors but not hematopoietic stem cells / Ann-Kathrin Fanti, Katrin Busch, Alessandro Greco, Xi Wang, Branko Cirovic, Fuwei Shang, Tamar Nizha… , 2 February 2023. - 20 S. : Illustrationen
  In: Cell stem cell, ISSN 1875-9777. 30(2023), 2 vom: Feb., Seite 207-218.e7
  DOI: 10.1016/j.stem.2022.12.014
• Nizharadze, Tamar: Differentiation tracing identifies hematopoietic regeneration from multipotent progenitors but not stem cells / Tamar Nizharadze, Katrin Busch, Ann-Kathrin Fanti, Hans-Reimer Rodewald, Thomas Höfer, September 2023. - 6 S.
  In: Cells & development, ISSN 2667-2901. 175(2023) vom: Sept., Artikel-ID 203861, Seite 1-6
  DOI: 10.1016/j.cdev.2023.203861
• Körber, Verena: Neuroblastoma arises in early fetal development and its evolutionary duration predicts outcome / Verena Körber, Sabine A. Stainczyk, Roma Kurilov, Kai-Oliver Henrich, Barbara Hero, Benedikt Brors, … , 27 March 2023. - 12 S.
  In: Nature genetics, ISSN 1546-1718. 55(2023), 4, Seite 1-12
  DOI: 10.1038/s41588-023-01332-y
• Carvajal Ibáñez, Damián: Interferon regulates neural stem cell function at all ages by orchestrating mTOR and cell cycle / Damian Carvajal Ibañez, Maxim Skabkin, Jooa Hooli, Santiago Cerrizuela, Manuel Göpferich, Adrien Jol… , 2023. - 18 S.
  In: EMBO molecular medicine, ISSN 1757-4684. (2023), Artikel-ID e16434, Seite 1-18
  DOI: 10.15252/emmm.202216434
• Dietlein, Nikolaus: Usp22 is an intracellular regulator of systemic emergency hematopoiesis / Nikolaus Dietlein, Xi Wang, Jonas Metz, Olivier Disson, Fuwei Shang, Celine Beyersdörffer, Esther Ro… , 9 Dec 2022. - 17 S.
  In: Science immunology, ISSN 2470-9468. 7(2022), 78 vom: Dez., Artikel-ID eabq2061, Seite 1-17
  DOI: 10.1126/sciimmunol.abq2061
• Pixberg, Constantin Frederic: Cognition : a prospective precision oncology trial for patients with early breast cancer at high risk following neoadjuvant chemotherapy / C. Pixberg, M. Zapatka, M. Hlevnjak, S. Benedetto, J.P. Suppelna, J. Heil, K. Smetanay, L. Michel, C… , 21 November 2022. - 12 S.
  In: ESMO open, ISSN 2059-7029. 7(2022), 6, Artikel-ID 100637, Seite 1-12
  DOI: 10.1016/j.esmoop.2022.100637
• Klein, Philipp: Temporal control of the integrated stress response by a stochastic molecular switch / Philipp Klein, Stefan M. Kallenberger, Hanna Roth, Karsten Roth, Thi Bach Nga Ly-Hartig, Vera Magg, … , 22 Mar 2022. - 21 S.
  In: Science advances, ISSN 2375-2548. 8(2022), 12, Artikel-ID eabk2022, Seite 1-21
  DOI: 10.1126/sciadv.abk2022
• Morcos, Mina: Fate mapping of hematopoietic stem cells reveals two pathways of native thrombopoiesis / Mina N.F. Morcos, Congxin Li, Clara M. Munz, Alessandro Greco, Nicole Dressel, Susanne Reinhardt, Ka… , 03 August 2022. - 13 S.
  In: Nature Communications, ISSN 2041-1723. 13(2022), Artikel-ID 4504, Seite 1-13
  DOI: 10.1038/s41467-022-31914-z
• Alborzinia, Hamed: MYCN mediates cysteine addiction and sensitizes neuroblastoma to ferroptosis / Hamed Alborzinia, Andrés F. Flórez, Sina Kreth, Lena M. Brückner, Umut Yildiz, Moritz Gartlgruber, D… , 28 April 2022. - 15 S.
  In: Nature cancer, ISSN 2662-1347. 3(2022), 4, Seite 471-485
  DOI: 10.1038/s43018-022-00355-4
• Klaus, Severina: Asynchronous nuclear cycles in multinucleated Plasmodium falciparum facilitate rapid proliferation / Severina Klaus, Patrick Binder, Juyeop Kim, Marta Machado, Charlotta Funaya, Violetta Schaaf, Darius… , 30 March 2022. - 12 S.
  In: Science advances, ISSN 2375-2548. 8(2022), 13 vom: März, Artikel-ID eabj5362, Seite 1-12
  DOI: 10.1126/sciadv.abj5362
• Simovic, Milena: Carbon ion radiotherapy eradicates medulloblastomas with chromothripsis in an orthotopic Li-Fraumeni patient-derived mouse model / Milena Simovic, Michiel Bolkestein, Mahmoud Moustafa, John K L Wong, Verena Körber, Sarah Benedetto,… , 28 May 2021. - 14 S.
  In: Neuro-Oncology, ISSN 1523-5866. 23(2021), 12, Seite 2028-2041
  DOI: 10.1093/neuonc/noab127
• Flommersfeld, Sophie: Fate mapping of single NK cells identifies a type 1 innate lymphoid-like lineage that bridges innate and adaptive recognition of viral infection / Sophie Flommersfeld, Jan P. Böttcher, Jonatan Ersching, Michael Flossdorf, Philippa Meiser, Ludwig O… , 25 August 2021. - 24 S.
  In: Immunity, ISSN 1097-4180. 54(2021,10), Seite 2288-2304, e1-e7, 24 Seiten
  DOI: 10.1016/j.immuni.2021.08.002
• Rastgou Talemi, Soheil: Dengue virus is sensitive to inhibition prior to productive replication / Soheil Rastgou Talemi, Marie Bartenschlager, Bianca Schmid, Alessia Ruggieri, Ralf Bartenschlager, a… , 12 October 2021. - 13 S.
  In: Cell reports, ISSN 2211-1247. 37(2021), 2, Artikel-ID 109801, Seite 1-13
  DOI: 10.1016/j.celrep.2021.109801
• Binder, Patrick: Optimal ligand discrimination by asymmetric dimerization and turnover of interferon receptors / Patrick Binder, Nikolas D. Schnellbächer, Thomas Höfer, Nils B. Becker, and Ulrich S. Schwarz, September 10, 2021. - 8 S.
  In: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, ISSN 1091-6490. 118(2021), 37, Artikel-ID e2103939118, Seite 1-8
  DOI: 10.1073/pnas.2103939118
• Jansky, Selina: Single-cell transcriptomic analyses provide insights into the developmental origins of neuroblastoma / Selina Jansky, Ashwini Kumar Sharma, Verena Körber, Andrés Quintero, Umut H. Toprak, Elisa M. Wecht,… , 25 March 2021. - 11 S.
  In: Nature genetics, ISSN 1546-1718. 53(2021), 5, Seite 683-693
  DOI: 10.1038/s41588-021-00806-1
• Grassmann, Simon: Early emergence of T central memory precursors programs clonal dominance during chronic viral infection / Simon Grassmann, Lorenz Mihatsch, Jonas Mir, Atefeh Kazeroonian, Roza Rahimi, Sophie Flommersfeld, K… , December 2020. - 24 S. : Illustrationen
  In: Nature immunology, ISSN 1529-2916. 21(2020), 12 vom: Dez., Seite 1563-1573, 1-4
  DOI: 10.1038/s41590-020-00807-y
• Bolkestein, Michiel: Chromothripsis in human breast cancer / Michiel Bolkestein, John K.L. Wong, Verena Thewes, Verena Körber, Mario Hlevnjak, Shaymaa Elgaafary,… , September 24, 2020. - 14 S.
  In: Cancer research, ISSN 1538-7445. 80(2020), 22, Seite 4918-4931
  DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-20-1920
• Pei, Weike: Resolving fates and single-cell transcriptomes of hematopoietic stem cell clones by PolyloxExpress barcoding / Weike Pei, Fuwei Shang, Xi Wang, Ann-Kathrin Fanti, Alessandro Greco, Katrin Busch, Kay Klapproth, Q… , 11 August 2020. - 13 S.
  In: Cell stem cell, ISSN 1875-9777. 27(2020), 3, Seite 383-395.e8
  DOI: 10.1016/j.stem.2020.07.018
• Ni, Jing: Single-cell RNA sequencing of tumor-infiltrating NK cells reveals that inhibition of transcription factor HIF-1α unleashes NK cell activity / authors: Jing Ni, Xi Wang, Ana Stojanovic, Qin Zhang, Marian Wincher, Lea Bühler, Annette Arnold, Ma… , 22 May 2020. - 22 S.
  In: Immunity, ISSN 1097-4180. 52(2020,6),1075-1087, e1-e8, 22 Seiten
  DOI: 10.1016/j.immuni.2020.05.001
• Kuchen, Erika: Hidden long-range memories of growth and cycle speed correlate cell cycles in lineage trees / Erika E. Kuchen, Nils B. Becker, Nina Claudino, Thomas Höfer, Jan 23, 2020. - ?$p9 (2020) Artikel-Nummer e51002 S.
  In: eLife, ISSN 2050-084X. 9(2020)
  DOI: 10.7554/eLife.51002
• Cossarizza, Andrea: Guidelines for the use of flow cytometry and cell sorting in immunological studies (second edition) / Andrea Cossarizza, Hyun-Dong Chang, Andreas Radbruch, Andreas Acs, Dieter Adam, Sabine Adam‐Klages, … , 21 October 2019. - 517 S.
  In: European journal of immunology, ISSN 1521-4141. 49(2019), 10, Seite 1457-1973
  DOI: 10.1002/eji.201970107
• SYS-GLIO: Systembasierte Vorhersagen für das biologische und klinische Verhalten von Gliomen : Abschlussbericht : Laufzeit des Vorhabens: 01.03.2015-28.02.2018 (verlängert bis 31.12.2018) : Berichtszeitraum: 01.03.2015-31.12.2018 / Zuwendungsempfänger: Prof. Dr. Peter Lichter, Leiter der Abteilung Molekulare Genetik, DKFZ; Prof. D… . -
  Heidelberg: DKFZ, [2019?]. - 1 Online-Ressource (8 Seiten, 95,42 KB)
  DOI: 10.2314/KXP:1689649704
• Pei, Weike: Using cre-recombinase-driven polylox barcoding for in vivo fate mapping in mice / Weike Pei, Xi Wang, Jens Roessler, Thorsten B. Feyerabend, Thomas Hoefer & Hans-Reimer Rodewald, 20 May 2019. - 21 S.
  In: Nature protocols, ISSN 1750-2799. 14(2019), 6, Seite 1820-1840
  DOI: 10.1038/s41596-019-0163-5
• Yousefi, Omid Sascha: Optogenetic control shows that kinetic proofreading regulates the activity of the T cell receptor / O Sascha Yousefi, Matthias Günther, Maximilian Hörner, Julia Chalupsky, Maximilian Wess, Simon M Bra… , 05 April 2019. - 33 S.
  In: eLife, ISSN 2050-084X. 8(2019) Artikel-Nummer e42475, 33 Seiten
  DOI: 10.7554/eLife.42475
• Körber, Verena: Evolutionary trajectories of IDHWT glioblastomas reveal a common path of early tumorigenesis instigated years ahead of initial diagnosis / Verena Körber, Jing Yang, Pankaj Barah, Yonghe Wu, Damian Stichel, Zuguang Gu, Michael Nai Chung Fle… , 21 March 2019. - 25 S.
  In: Cancer cell, ISSN 1878-3686. 35(2019,4) Seite 692-704.e1-e12
  DOI: 10.1016/j.ccell.2019.02.007
• Apweiler, Rolf: Whither systems medicine? / Rolf Apweiler, Tim Beissbarth, Michael R Berthold, Nils Blüthgen, Yvonne Burmeister, Olaf Dammann, A… , 2 March 2018. - 6 S.
  In: Experimental & molecular medicine, ISSN 2092-6413. 50(2018,3) Artikel-Nummer e453, 6 Seiten
  DOI: 10.1038/emm.2017.290
• Pervolaraki, Kalliopi: Differential induction of interferon stimulated genes between type I and type III interferons is independent of interferon receptor abundance / Kalliopi Pervolaraki, Soheil Rastgou Talemi, Dorothee Albrecht, Felix Bormann, Connor Bamford, Juan … , November 28, 2018. - 31 S.
  In: PLoS pathogens, ISSN 1553-7374. 14(2018,11) Artikel-Nummer e1007420, 31 Seiten
  DOI: 10.1371/journal.ppat.1007420
• Höfer, Thomas: Differentiation-based model of hematopoietic stem cell functions and lineage pathways / Thomas Höfer and Hans-Reimer Rodewald, September 13, 2018. - 8 S.
  In: Blood, ISSN 1528-0020. 132(2018), 11, Seite 1106-1113
  DOI: 10.1182/blood-2018-03-791517
• SYS-GLIO: Systembasierte Vorhersagen für das biologische und klinische Verhalten von Gliomen : Abschlussbericht : Laufzeit des Vorhabens: 01.03.2015-28.02.2018 (verlängert bis 31.12.2018) : Berichtszeitraum: 01.03.2015-31.12.2018 / Zuwendungsempfänger: Prof. Dr. Peter Lichter, Leiter der Abteilung Molekulare Genetik, DKFZ; Prof. D… . -
  Heidelberg: DKFZ, [2018?]. - 8 Blätter
• Li, Congxin: Frequency modulation of transcriptional bursting enables sensitive and rapid gene regulation / Congxin Li, François Cesbron, Michael Oehler, Michael Brunner, Thomas Höfer, 14 February 2018. - 27 S.
  In: Cell systems, ISSN 2405-4720. 6(2018), 4, Seite 409-423.e11
  DOI: 10.1016/j.cels.2018.01.012
• Murugan, Rajagopal: Clonal selection drives protective memory B cell responses in controlled human malaria infection / Rajagopal Murugan, Lisa Buchauer, Gianna Triller, Cornelia Kreschel, Giulia Costa, Gemma Pidelaserra… , 2018. - 10 S.
  In: Science immunology, ISSN 2470-9468. 3(2018,20) Artikel-Nummer eaap8029, 10 Seiten
  DOI: 10.1126/sciimmunol.aap8029
• Brors, Benedikt: Forschungskonsortien zur Systemmedizin e:Med-Initiative: Systemmedizin beim Neuroblastom : SYSMED-NB : Teilprojekte: A1: TP-Leiter: Prof. Benedikt Brors, DKFZ; A3: TP Leiter: Matthias Selbach, Max Delbrück Center für Molekulare Medizin, TP Partner: PD Dr. Frank Westermann, DKFZ; B1: TP-Leiter: PD Dr. Frank Westermann, Prof. Dr. Thomas Höfer, DKFZ; B4: TP Leiter: Hedwig E. Deubzer Charité, Berlin; TP-Partner: Prof. Dr. Thomas Höfer, DKFZ : Schlussbericht über den Projektverlauf vom 01.08.2014 bis 31.07.2017 / Teilprojektpartner (des Standortes): Prof. Dr. Benedikt Brors, Prof. Dr. Thomas Höfer, PD Dr. Frank … . -
  [Heidelberg]: [Deutsches Krebsforschungszentrum], 30.01.2018. - 1 Online-Ressource (21 Seiten, 395,82 KB) : Diagramme
  DOI: 10.2314/GBV:1022268872
• Brors, Benedikt: Forschungskonsortien zur Systemmedizin e:Med-Initiative: Systemmedizin beim Neuroblastom : SYSMED-NB : Teilprojekte: A1: TP-Leiter: Prof. Benedikt Brors, DKFZ; A3: TP Leiter: Matthias Selbach Max Delbrück Center für Molekulare Medizin, TP Partner: PD Dr. Frank Westermann, DKFZ; B1: TP-Leiter: PD Dr. Frank Westermann, Prof. Dr. Thomas Höfer, DKFZ; B4: TP Leiter: Hedwig E. Deubzer Charité, Berlin; TP-Partner: Prof. Dr. Thomas Höfer, DKFZ : Schlussbericht über den Projektverlauf vom 01.08.2014 bis 31.07.2017 / Teilprojektpartner (des Standortes): Prof. Dr. Benedikt Brors, Prof. Dr. Thomas Höfer, PD Dr. Frank … . -
  [Heidelberg]: [Deutsches Krebsforschungszentrum], 30.01.2018. - 19 Blätter, 2 ungezählte Blätter : Diagramme
• Rastgou Talemi, Soheil: Antiviral interferon response at single-cell resolution / Soheil Rastgou Talemi, Thomas Höfer, 11 August 2018. - 9 S.
  In: Immunological reviews, ISSN 1600-065X. 285(2018), 1, Seite 72-80
  DOI: 10.1111/imr.12699
• Höfer, Thomas: E:Bio - Modul I : Verbundprojekt ImmunoQuant - Multiskalenmodellierung der angeborenen Immunabwehr gegen virale Infektionen : Teilprojekt H : Schlussbericht / Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg ; Projektleiter Prof. Dr. Thomas Höfer und Prof. Dr. Roland Ei… . -
  [Heidelberg]: [Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg], 24.10.2017. - 1 Online-Ressource (27 Seiten, 342,00 KB)
  DOI: 10.2314/GBV:1022349384
• Höfer, Thomas: E:Bio - Modul I : Verbundprojekt ImmunoQuant - Multiskalenmodellierung der angeborenen Immunabwehr gegen virale Infektionen : Teilprojekt H : Schlussbericht / Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg ; Projektleiter Prof. Dr. Thomas Höfer und Prof. Dr. Roland Ei… . -
  [Heidelberg]: [Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg], 23.10.2017. - 26 Seiten, 1 ungezählte Seite
• Höfer, Thomas: E:Bio - Modul I : Verbundprojekt ImmunoQuant - Multiskalenmodellierung der angeborenen Immunabwehr gegen virale Infektionen : Teilprojekt M : Schlussbericht / Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ) Heidelberg ; Projektleiter Prof. Dr. Thomas Höfer. -
  [Heidelberg]: [Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ)], 05/2017. - 1 Online-Ressource (19 Seiten, 5,38 MB) : Diagramme
  DOI: 10.2314/GBV:1002662591
• Höfer, Thomas: E:Bio - Modul I : Verbundprojekt ImmunoQuant - Multiskalenmodellierung der angeborenen Immunabwehr gegen virale Infektionen : Teilprojekt M : Schlussbericht / Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ) Heidelberg ; Projektleiter Prof. Dr. Thomas Höfer. -
  [Heidelberg]: [Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ)], 05/2017. - 18 Seiten, 1 ungezähltes Blatt : Diagramme
• Cho, Yi-Li: TCR signal quality modulates fate decisions of single CD4+ T cells in a probabilistic manner / Yi-Li Cho, Michael Flossdorf, Lorenz Kretschmer, Thomas Höfer, Dirk H. Busch, Veit R. Buchholz, 25 July 2017. - 13 S.
  In: Cell reports, ISSN 2211-1247. 20(2017), 4, Seite 806-818
  DOI: 10.1016/j.celrep.2017.07.005
• Pei, Weike: Polylox barcoding reveals haematopoietic stem cell fates realized in vivo / Weike Pei, Thorsten B. Feyerabend, Jens Rössler, Xi Wang, Daniel Postrach, Katrin Busch, Immanuel Ro… , 16 August 2017. - 5 S.
  In: Nature, ISSN 1476-4687. 548(2017), 7668, Seite 456-460
  DOI: 10.1038/nature23653
• Ryl, Tatsiana: Cell-cycle position of single MYC-driven cancer cells dictates their susceptibility to a chemotherapeutic drug / Tatsiana Ryl, Erika E. Kuchen, Emma Bell, Chunxuan Shao, Andrés F. Flórez, Gregor Mönke, Sina Gogoli… , 23 August 2017. - 22 S.
  In: Cell systems, ISSN 2405-4720. 5(2017,3) Seite 237-250, e1-e8, 22 Seiten
  DOI: 10.1016/j.cels.2017.07.005
• Adlung, Lorenz: Protein abundance of AKT and ERK pathway components governs cell type‐specific regulation of proliferation / Lorenz Adlung, Sandip Kar, Marie-Christine Wagner, Bin She, Sajib Chakraborty, Jie Bao, Susen Latter… , 24.01.2017. - 25 S.
  In: Molecular systems biology, ISSN 1744-4292. 13(2017,1) Artikel-Nummer 904, 25 Seiten
  DOI: 10.15252/msb.20167258
• Schamel, Wolfgang: The allostery model of TCR regulation / Wolfgang W.A. Schamel, Balbino Alarcon, Thomas Höfer, and Susana Minguet, 2017. - 6 S.
  In: The journal of immunology, ISSN 1550-6606. 198(2017), 1, Seite 47-52
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• Poschke, Isabel: Identification of a tumor-reactive T-cell repertoire in the immune infiltrate of patients with resectable pancreatic ductal adenocarcinoma / Isabel Poschke, Marta Faryna, Frank Bergmann, Michael Flossdorf, Claudia Lauenstein, Jennifer Hermes… , 29 Nov 2016. - 12 S.
  In: OncoImmunology, ISSN 2162-402X. 5(2016,12), Artikel-Nummer e1240859, 12 Seiten
  DOI: 10.1080/2162402X.2016.1240859
• Schlussbericht zum e:Bio-Modul I-Verbundprojekt „T-Sys - Immunmodulation statt alleiniger Immunsuppression“ : WP 3 - Teilprojekt 6: Zusammenspiel der epigenetischen und transkriptionellen Prägung der T-Helferzelldifferenzierung - Theoretische Analyse : Laufzeit des Vorhabens: 01.01.2013-31.12.2015 / Zuwendungsempfänger: DKFZ Heidelberg ; Projektleiter: Prof. Thomas Höfer, Abteilung Theoretische Sys… . -
  Heidelberg: DKFZ Heidelberg, [2016?]. - 1 Online-Ressource (19 Seiten, 3,73 MB) : Illustrationen, Diagramme
  DOI: 10.2314/GBV:883833018
• Schlussbericht zum e:Bio-Modul I-Verbundprojekt „T-Sys - Immunmodulation statt alleiniger Immunsuppression“ : WP 3 - Teilprojekt 6: Zusammenspiel der epigenetischen und transkriptionellen Prägung der T-Helferzelldifferenzierung - Theoretische Analyse : Laufzeit des Vorhabens: 01.01.2013-31.12.2015 / Zuwendungsempfänger: DKFZ Heidelberg ; Projektleiter: Prof. Thomas Höfer, Abteilung Theoretische Sys… . -
  Heidelberg: DKFZ Heidelberg, [2016?]. - 19 Seiten : Illustrationen, Diagramme
• Rippe, Karsten: Schlussbericht zum Teilprojekt A im CancerSys - Verbundprojekt "CancerEpiSys - Integrative Analyse epigenetischer Netzwerke bei chronisch lymphatischer Leukämie" : Laufzeit des Vorhabens: 1. 3. 2012-28. 2. 2015, mit zuwendungsneutraler Verlängerung bis zum 31. 8. 2015 / Zuwendungsempfänger: Deutsches Krebsforschungszentrum, Heidelberg, ausführende Stelle: Deutsches Kre… . -
  Heidelberg: Deutsches Krebsforschungszentrum, [2016?]. - 1 Online-Ressource (32 Seiten, 355,95 KB)
  DOI: 10.2314/GBV:870579649
• Rippe, Karsten: Schlussbericht zum Teilprojekt A im CancerSys - Verbundprojekt "CancerEpiSys - Integrative Analyse epigenetischer Netzwerke bei chronisch lymphatischer Leukämie" : Laufzeit des Vorhabens: 1. 3. 2012-28. 2. 2015, mit zuwendungsneutraler Verlängerung bis zum 31. 8. 2015 / Zuwendungsempfänger: Deutsches Krebsforschungszentrum, Heidelberg, ausführende Stelle: Deutsches Kre… . -
  Heidelberg: Deutsches Krebsforschungszentrum, [2016?]. - 31 Blätter, 1 ungezähltes Blatt
• Swamy, Mahima: A cholesterol-based allostery model of T cell receptor phosphorylation / Mahima Swamy, Katharina Beck-Garcia, Esmeralda Beck-Garcia, Frederike A. Hartl, Anna Morath, O. Sasc… , May 17, 2016. - 11 S.
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• Höfer, Thomas: Stem-cell dynamics and lineage topology from in vivo fate mapping in the hematopoietic system / Thomas Höfer, Melania Barile, Michael Flossdorf, 20th April 2016. - 7 S.
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• Höfer, Thomas: Schlussbericht zum CancerSys-Verbundprojekt "MYC-NET - Aufklärung der Mechanismen MYC-getriebener Therapieresistenz neuroectodermaler Tumore", Teilprojekt Systembiologische Analyse : Systembiologie in der Krebsforschung - CancerSys : Laufzeit des Vorhabens: 01.03.2012-28.02.2015, zuwendungsneutrale Verlängerung: 01.03.2015-30.09.2015 / Zuwendungsempfänger: DKFZ ; Prof. Dr. Thomas Höfer (DKFZ, Modellierung Biologischer Systeme), PD Dr.… . -
  Heidelberg: DKFZ, Juni 2016. - 1 Online-Ressource (33 Seiten, 639,98 KB)
  DOI: 10.2314/GBV:883839237
• Höfer, Thomas: Schlussbericht zum CancerSys-Verbundprojekt "MYC-NET - Aufklärung der Mechanismen MYC-getriebener Therapieresistenz neuroectodermaler Tumore", Teilprojekt Systembiologische Analyse : Systembiologie in der Krebsforschung - CancerSys : Laufzeit des Vorhabens: 01.03.2012-28.02.2015, zuwendungsneutrale Verlängerung: 01.03.2015-30.09.2015 / Zuwendungsempfänger: DKFZ ; Prof. Dr. Thomas Höfer (DKFZ, Modellierung Biologischer Systeme), PD Dr.… . -
  Heidelberg: DKFZ, Juni 2016. - 33 Seiten
• Shao, Chunxuan: Robust classification of single-cell transcriptome data by nonnegative matrix factorization / Chunxuan Shao and Thomas Höfer, 2017. - 8 S.
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• Floßdorf, Michael: CD8+ T cell diversification by asymmetric cell division / Michael Flossdorf, Jens Rössler, Veit R. Buchholz, Dirk H. Busch & Thomas Höfer, 19 August 2015. - 3 S.
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• Busch, Katrin: Fundamental properties of unperturbed haematopoiesis from stem cells in vivo / Katrin Busch, Kay Klapproth, Melania Barile, Michael Flossdorf, Tim Holland-Letz, Susan M. Schlenner… , 11 February 2015. - 5 S.
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• Helmstetter, Caroline: Individual T helper cells have a quantitative cytokine memory / Caroline Helmstetter, Michael Flossdorf, Michael Peine, Andreas Kupz, Jinfang Zhu, Ahmed N. Hegazy, … , 2015. - 15 S.
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  DOI: 10.1016/j.immuni.2014.12.018
• Pfister, Stefan: Schlussbericht zum CancerSys-Verbundprojekt „MYC-NET - Aufklärung der Mechanismen MYC-getriebener Therapieresistenz neuroectodermaler Tumore“ : Laufzeit des Vorhabens: 01.03.2012-28.02.2015 / Zuwendungsempfänger: Universitätsklinikum Heidelberg, Abteilung Pädiatrische Hämatologie und Onkolog… . -
  Heidelberg: Universitätsklinikum Heidelberg, Abteilung Pädiatrische Hämatologie und Onkologie, 31.08.2015. - 1 Online-Ressource (14 Seiten, 657,76 KB) : Illustration
  DOI: 10.2314/GBV:872584631
• Pfister, Stefan: Schlussbericht zum CancerSys-Verbundprojekt „MYC-NET - Aufklärung der Mechanismen MYC-getriebener Therapieresistenz neuroectodermaler Tumore“ : Laufzeit des Vorhabens: 01.03.2012-28.02.2015 / Zuwendungsempfänger: Universitätsklinikum Heidelberg, Abteilung Pädiatrische Hämatologie und Onkolog… . -
  Heidelberg: Universitätsklinikum Heidelberg, Abteilung Pädiatrische Hämatologie und Onkologie, 31.08.2015. - 13 Blätter, 1 ungezähltes Blatt : Illustration
• Schmid, Bianca: Live cell analysis and mathematical modeling identify determinants of attenuation of Dengue virus 2’-o-methylation mutant / Bianca Schmid, Melanie Rinas, Alessia Ruggieri, Eliana Gisela Acosta, Marie Bartenschlager, Antje Re… , December 31, 2015
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• Raue, Andreas: Data2Dynamics : a modeling environment tailored to parameter estimation in dynamical systems / A. Raue, B. Steiert, M. Schelker, C. Kreutz, T. Maiwald, H. Hass, J. Vanlier, C. Tönsing, L. Adlung,… , [2015]. - 3 S. : Diagramme
  In: Bioinformatics, ISSN 1367-4811. 31(2015), 21, Seite 3558-3560
  DOI: 10.1093/bioinformatics/btv405
• Mende, Nicole: CCND1-CDK4-mediated cell cycle progression provides a competitive advantage for human hematopoietic stem cells in vivo / Nicole Mende, Erika E. Kuchen, Mathias Lesche, Tatyana Grinenko, Konstantinos D. Kokkaliaris, Helmut… , July 6, 2015. - 13 S.
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• Thurley, Kevin: Three-dimensional gradients of cytokine signaling between T cells / Kevin Thurley, Daniel Gerecht, Elfriede Friedmann, Thomas Höfer, April 29, 2015. - 22 S.
  In: PLoS Computational Biology, ISSN 1553-7358. 11(2015,4) Artikel-Nummer e1004206, 22 Seiten
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• Peine, Michael: Stable T-bet+GATA-3+ Th1/Th2 hybrid cells arise in vivo, can develop directly from naive precursors, and limit immunopathologic inflammation / Michael Peine, Sebastian Rausch, Caroline Helmstetter, Anja Fröhlich, Ahmed N. Hegazy, Anja A. Kühl,… , August 20, 2013. - 17 S.
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• Buchholz, Veit: Disparate individual fates compose robust CD8+ T cell immunity / Veit R. Buchholz, Michael Flossdorf, Inge Hensel, Lorenz Kretschmer, Bianca Weissbrich, Patricia Grä… , 14 March 2013. - 6 S.
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